基因页:pan2
概括?
基因 | 9924 |
象征 | pan2 |
同义词 | USP52 |
描述 | pan2 poly(a)特定的核糖核酸酶亚基 |
参考 | HGNC:HGNC:20074|ENSEMBL:ENSG00000135473|HPRD:15640|Vega:Otthumg00000170412 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12q13.3 |
Pascal P值 | 0.042 |
Sherlock P值 | 0.592 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | pan2 | 9924 | 0.09 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | pan2 | 9924 | 0 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PAN2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MOCS2 | 0.86 | 0.86 |
TMEM111 | 0.85 | 0.87 |
顺式1 | 0.83 | 0.87 |
ube2f | 0.82 | 0.83 |
MDH1 | 0.81 | 0.85 |
NDUFAF4 | 0.80 | 0.81 |
Cacybp | 0.80 | 0.83 |
POP4 | 0.79 | 0.78 |
TTC1 | 0.79 | 0.81 |
NDUFA9 | 0.79 | 0.82 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SMTN | -0.45 | -0.51 |
anp32c | -0.41 | -0.42 |
AC010300.1 | -0.40 | -0.36 |
AF347015.18 | -0.39 | -0.16 |
RP4-697K14.1 | -0.39 | -0.46 |
Caskin2 | -0.38 | -0.37 |
SH2D2A | -0.37 | -0.43 |
AC100783.1 | -0.37 | -0.32 |
cdc42ep4 | -0.37 | -0.39 |
SH3BP2 | -0.37 | -0.41 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 | 207 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LUI甲状腺癌簇2 | 42 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标1向上 | 140 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
brocke凋亡由IL6逆转 | 144 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 UP | 89 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成pparg rxra绑定36小时 | 152 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |