概括
基因 9924
象征 pan2
同义词 USP52
描述 pan2 poly(a)特定的核糖核酸酶亚基
参考 HGNC:HGNC:20074|ENSEMBL:ENSG00000135473|HPRD:15640|Vega:Otthumg00000170412
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12q13.3
Pascal P值 0.042
Sherlock P值 0.592
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 pan2 9924 0.09 反式
RS16955618 CHR15 29937543 pan2 9924 0 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MOCS2 0.86 0.86
TMEM111 0.85 0.87
顺式1 0.83 0.87
ube2f 0.82 0.83
MDH1 0.81 0.85
NDUFAF4 0.80 0.81
Cacybp 0.80 0.83
POP4 0.79 0.78
TTC1 0.79 0.81
NDUFA9 0.79 0.82
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SMTN -0.45 -0.51
anp32c -0.41 -0.42
AC010300.1 -0.40 -0.36
AF347015.18 -0.39 -0.16
RP4-697K14.1 -0.39 -0.46
Caskin2 -0.38 -0.37
SH2D2A -0.37 -0.43
AC100783.1 -0.37 -0.32
cdc42ep4 -0.37 -0.39
SH3BP2 -0.37 -0.41

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 207 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI甲状腺癌簇2 42 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标1向上 140 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
brocke凋亡由IL6逆转 144 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 UP 89 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向DN 314 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成pparg rxra绑定36小时 152 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因