基因页:MFN2
概括?
基因 | 9927 |
象征 | MFN2 |
同义词 | CMT2A | CMT2A2 | CPRP1 | HMSN6A | HSG | MARF |
描述 | 丝线2 |
参考 | MIM:608507|HGNC:HGNC:16877|ENSEMBL:ENSG00000116688|HPRD:08495|Vega:Otthumg00000002392 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p36.22 |
Pascal P值 | 0.035 |
Sherlock P值 | 0.6 |
胎儿β | -0.596 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7367104 | CHR1 | 110483916 | MFN2 | 9927 | 0.07 | 反式 | ||
RS791272 | CHR1 | 147235594 | MFN2 | 9927 | 0.16 | 反式 | ||
RS6535720 | CHR4 | 151112504 | MFN2 | 9927 | 0.17 | 反式 | ||
RS1418921 | CHR6 | 121335635 | MFN2 | 9927 | 0.09 | 反式 | ||
RS12303876 | CHR12 | 31146533 | MFN2 | 9927 | 0.16 | 反式 | ||
RS11564259 | CHR12 | 40792196 | MFN2 | 9927 | 0.12 | 反式 | ||
RS11564258 | CHR12 | 40792299 | MFN2 | 9927 | 0.12 | 反式 | ||
RS11564144 | CHR12 | 40817994 | MFN2 | 9927 | 0.12 | 反式 | ||
RS11564247 | CHR12 | 40821477 | MFN2 | 9927 | 0.04 | 反式 | ||
RS984325 | CHR16 | 7772248 | MFN2 | 9927 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MFN2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
巨核细胞发育和血小板产生涉及的反应组因素 | 132 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dittmer Pthlh靶向 | 112 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MANALO缺氧DN | 289 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
怀特福德小儿癌标记 | 116 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ivanovska mir106b目标 | 90 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Linsley mir16目标 | 206 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |