概括
基因 9927
象征 MFN2
同义词 CMT2A | CMT2A2 | CPRP1 | HMSN6A | HSG | MARF
描述 丝线2
参考 MIM:608507|HGNC:HGNC:16877|ENSEMBL:ENSG00000116688|HPRD:08495|Vega:Otthumg00000002392
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p36.22
Pascal P值 0.035
Sherlock P值 0.6
胎儿β -0.596
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7367104 CHR1 110483916 MFN2 9927 0.07 反式
RS791272 CHR1 147235594 MFN2 9927 0.16 反式
RS6535720 CHR4 151112504 MFN2 9927 0.17 反式
RS1418921 CHR6 121335635 MFN2 9927 0.09 反式
RS12303876 CHR12 31146533 MFN2 9927 0.16 反式
RS11564259 CHR12 40792196 MFN2 9927 0.12 反式
RS11564258 CHR12 40792299 MFN2 9927 0.12 反式
RS11564144 CHR12 40817994 MFN2 9927 0.12 反式
RS11564247 CHR12 40821477 MFN2 9927 0.04 反式
RS984325 CHR16 7772248 MFN2 9927 0.07 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
巨核细胞发育和血小板产生涉及的反应组因素 132 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dittmer Pthlh靶向 112 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO缺氧DN 289 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN 274 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
怀特福德小儿癌标记 116 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ivanovska mir106b目标 90 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Linsley mir16目标 206 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因