基因页面:HS3ST3A1
总结吗?
| GeneID | 9955年 |
| 象征 | HS3ST3A1 |
| 同义词 | 3-OST-3A | 3 ost3a1 |
| 描述 | 乙酰肝素sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3 a1 |
| 参考 | MIM: 604057|HGNC: HGNC: 5196|HPRD: 04958| |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 17 p12 |
| 帕斯卡假定值 | 0.008 |
| 胎儿β | -1.337 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs592664 | chr10 | 35995299 | HS3ST3A1 | 9955年 | 0.19 | 反式 | ||
| rs1026519 | chr18 | 74801677 | HS3ST3A1 | 9955年 | 0.07 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SEPT6 | 0.82 | 0.88 |
| TUSC3 | 0.82 | 0.91 |
| AKR1C2 | 0.81 | 0.87 |
| CDC42 | 0.80 | 0.87 |
| AC110814.1 | 0.80 | 0.89 |
| ANKRD5 | 0.80 | 0.87 |
| DHRS13 | 0.80 | 0.83 |
| FUCA1 | 0.80 | 0.87 |
| EIF4G2 | 0.79 | 0.87 |
| VAT1 | 0.79 | 0.87 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| HLA-F | -0.65 | -0.77 |
| SPARCL1 | -0.63 | -0.69 |
| SLC16A11 | -0.61 | -0.67 |
| HEPN1 | -0.61 | -0.74 |
| C5orf53 | -0.61 | -0.72 |
| PTH1R | -0.61 | -0.73 |
| TNFSF12 | -0.61 | -0.69 |
| TSC22D4 | -0.60 | -0.75 |
| CA4 | -0.60 | -0.71 |
| AF347015.31 | -0.60 | -0.79 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG粘多糖降解 | 21 | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG粘多糖生物合成硫酸乙酰肝素 | 26 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME HS GAG生物合成 | 31日 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME硫酸乙酰肝素肝素HS插科打诨的新陈代谢 | 52 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME粘多糖代谢 | 111年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME代谢碳水化合物 | 247年 | 154年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过SMAD4 JAZAG TGFB1信号 | 108年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时DN | 911年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE应对TOSEDOSTAT 24小时DN | 1011年 | 592年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 华莱士前列腺癌竞赛 | 299年 | 167年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 恩格尔曼氏癌症祖细胞DN | 70年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 射线能够以ERBB2 CDC25A | 104年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布卢姆应对SALIRASIB DN | 342年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| POOLA浸润性乳腺癌 | 288年 | 168年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳人大HCP H3K4ME2 | 491年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PCA2 NAKAYAMA软组织肿瘤 | 87年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 210年 | 148年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HOELZEL NF1目标了 | 139年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过KDM3A KRIEG缺氧不 | 770年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LIM乳腺干细胞 | 489年 | 314年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |