基因页：CDC27
概括？
| 基因 | 996 |
| 象征 | CDC27 |
| 同义词 | anapc3 | apc3 | cdc27hs | d0s1430e | d17s978e | h-nuc | hnuc | nuc2 |
| 描述 | 细胞分裂周期27 |
| 参考 | MIM：116946|HGNC：HGNC：1728|Ensembl：ENSG00000004897|HPRD：00304|Vega：Otthumg00000166429 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17q21.32 |
| Pascal P值 | 0.174 |
| Sherlock P值 | 0.015 |
| 胎儿β | -0.463 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS11051641 | CHR12 | 32020255 | CDC27 | 996 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ST3GAL1 | 0.82 | 0.84 |
| SSBP3 | 0.82 | 0.79 |
| TP53I11 | 0.80 | 0.93 |
| AC127496.3 | 0.80 | 0.83 |
| bcl7a | 0.78 | 0.90 |
| SEZ6 | 0.78 | 0.92 |
| C14orf37 | 0.77 | 0.81 |
| SOBP | 0.77 | 0.90 |
| SRGAP2 | 0.77 | 0.89 |
| ATXN7L1 | 0.77 | 0.90 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| serpinb6 | -0.60 | -0.75 |
| hepn1 | -0.57 | -0.75 |
| S100B | -0.57 | -0.83 |
| AP003117.1 | -0.56 | -0.68 |
| AF347015.27 | -0.56 | -0.85 |
| TSC22D4 | -0.56 | -0.77 |
| HLA-F | -0.56 | -0.75 |
| AIFM3 | -0.56 | -0.75 |
| AF347015.31 | -0.56 | -0.84 |
| AF347015.33 | -0.56 | -0.85 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ANAPC1 | APC1 |MCPR |TSG24 | 后期促进复合体亚基1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共纯化 |
Biogrid | 11076961|12956947 |
| ANAPC10 | APC10 |DKFZP564L0562 |DOC1 | 后期促进复合物亚基10 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12956947 |
| ANAPC11 | APC11 |APC11P |HSPC214 |MGC882 | 后期促进复合物亚基11 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12956947 |
| ANAPC4 | APC4 | 后期促进复合物亚基4 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12956947 |
| ANAPC5 | APC5 | 后期促进复合物亚基5 | - | HPRD，Biogrid | 10922056 |
| ANAPC7 | APC7 | 后期促进复合物亚基7 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12956947 |
| APC2 | APCL | 腺瘤性息肉病2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12956947 |
| bub1b | bub1beta |bubr1 |bub1a |mad3l |SSK1 |HBUBR1 | 苯二咪唑1同源β（酵母）不受抑制的萌芽 | - | HPRD，Biogrid | 10477750 |
| CDC16 | APC6 | 细胞分裂周期16同源物（S. cerevisiae） | - | HPRD，Biogrid | 9405394 |
| CDC20 | CDC20A |MGC102824 |BA276H19.3 |p55cdc | 细胞分裂周期20同源物（S. cerevisiae） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 9628895|9736712 |9811605|12196507 |12956947|14561775 |
| CDC20 | CDC20A |MGC102824 |BA276H19.3 |p55cdc | 细胞分裂周期20同源物（S. cerevisiae） | - | HPRD | 9736712|12196507 |
| CDC23 | APC8 | 细胞分裂周期23同源物（S. cerevisiae） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12956947 |
| CDH1 | 弧1 |CD324 |cdhe |ECAD |lcam |UVO | 钙粘蛋白1，1型，e-钙粘蛋白（上皮） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 12956947 |
| FZR1 | CDC20C |CDH1 |fzr |fzr2 |HCDH |HCDH1 |KIAA1242 | Fizzy/Cell Disecom Cyper 20相关1（果蝇） | CDH1与CDC27相互作用。 | 绑定 | 15916961 |
| FZR1 | CDC20C |CDH1 |fzr |fzr2 |HCDH |HCDH1 |KIAA1242 | Fizzy/Cell Disecom Cyper 20相关1（果蝇） | - | HPRD，Biogrid | 12797865 |
| HOXC10 | Hox3i |MGC5259 | HONEOBOX C10 | - | HPRD | 12853486 |
| MAD2L1 | HSMAD2 |MAD2 | MAD2有丝分裂逮捕不足1（酵母） | - | HPRD，Biogrid | 9736712 |
| PIN1 | 国防部|UBL5 | 肽基丙基顺式/反式异构酶，NIMA相互作用1 | - | HPRD，Biogrid | 9499405|10939594 |
| PIN1 | 国防部|UBL5 | 肽基丙基顺式/反式异构酶，NIMA相互作用1 | PIN1与CDC27相互作用。 | 绑定 | 9499405 |
| PPP5C | FLJ36922 |pp5 |PPP5 | 蛋白质磷酸酶5，催化亚基 | - | HPRD，Biogrid | 9405394 |
| 冰鞋 | sno |snoa |SNON | 滑雪型癌基因 | - | HPRD | 11691834 |
| Smad2 | JV18 |JV18-1 |madh2 |Madr2 |MGC22139 |MGC34440 |HMAD-2 |HSMAD2 | SMAD家庭成员2 | - | HPRD，Biogrid | 11691834 |
| Smad3 | DKFZP586N0721 |DKFZP686J10186 |HSPC193 |HST17436 |JV15-2 |madh3 |MGC60396 | SMAD家庭成员3 | - | HPRD，Biogrid | 11691834 |
| SPATC1 | MGC61633 |spata15 |蜘蛛蛋白 | 精子发生和中心相关1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15280373 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg细胞周期 | 128 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg卵母细胞减数分裂 | 114 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG泛素介导的蛋白水解 | 138 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG孕酮介导的卵母细胞成熟 | 86 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome抑制有丝分裂主轴检查点成分的APC C的蛋白水解活性 | 24 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞周期有丝分裂 | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞周期检查点 | 124 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 有丝分裂细胞周期的反应组调节 | 85 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome APC C CDH1介导的CDC20和其他APC C CDH1靶向蛋白质的降解早期G1早期 | 72 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome APC C CDC20介导的有丝分裂蛋白降解 | 73 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CDH1 APC C对CDH1的反应组自动降解 | 64 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome APC C CDC20介导的细胞周期蛋白B的降解 | 26 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome从APC C CDC20转换为后期的APC C CDH1 | 22 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| APC C的反应组磷酸化 | 23 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome APC CDC20介导的NEK2A降解 | 28 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Borczuk恶性间皮瘤 | 305 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Horiuchi WTAP目标DN | 310 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1靶向 | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC2靶向 | 114 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇3 DN | 229 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WAESCH后期促进复合物 | 12 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer Sox9在前列腺发展中的目标DN | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amit EGF响应120 HELA | 69 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sakai肿瘤浸润单核细胞DN | 81 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标1 DN | 169 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shepard粉碎和燃烧突变体DN | 185 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 | 314 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染18小时 | 178 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病初期DN | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯对trabectedin dn的反应 | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| OUILLETTE CLL 13Q14删除 | 74 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| de yy1靶向DN | 92 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng Werner综合征和正常老化DN | 225 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 惠特菲尔德细胞周期g2 m | 216 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Linsley mir16目标 | 206 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |