基因页:FGF19
概括?
基因 | 9965 |
象征 | FGF19 |
同义词 | - |
描述 | 成纤维细胞生长因子19 |
参考 | MIM:603891|HGNC:HGNC:3675|ENSEMBL:ENSG00000162344|HPRD:04868|Vega:Otthumg00000167886 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q13.1 |
Pascal P值 | 0.561 |
胎儿β | 0.899 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FGF19_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
LDB3 | 0.95 | 0.89 |
ERBB3 | 0.95 | 0.87 |
nipal4 | 0.94 | 0.86 |
ttyh2 | 0.93 | 0.81 |
FA2H | 0.93 | 0.90 |
SLC5A11 | 0.93 | 0.90 |
C11orf9 | 0.93 | 0.90 |
ATPGD1 | 0.93 | 0.91 |
猫 | 0.93 | 0.89 |
TF | 0.92 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
nkiras2 | -0.53 | -0.62 |
HN1 | -0.52 | -0.65 |
tubb2b | -0.52 | -0.69 |
CRMP1 | -0.51 | -0.61 |
YBX1 | -0.51 | -0.72 |
STMN1 | -0.51 | -0.65 |
Med19 | -0.51 | -0.65 |
NR2C2AP | -0.51 | -0.68 |
HMGB3 | -0.51 | -0.65 |
塔布 | -0.51 | -0.64 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008083 | 生长因子活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突(GO期限:5) | 9931477 |
去:0001755 | 神经rest细胞迁移 | IEA | - | |
去:0007507 | 心脏发展 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | 经验 | 11294897|16597617 | |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg mapk信号通路 | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg黑色素瘤 | 71 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID FGF途径 | 55 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR信号的Reactome负调节 | 37 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胰岛素受体信号传导级联 | 87 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR在疾病中的反应组信号传导 | 127 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome FRS2介导的级联 | 36 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Pi 3K级联 | 56 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome的下游信号传导激活的FGFR | 100 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome磷脂酶C介导的级联 | 54 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SHC介导的级联 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胰岛素受体的反应组信号传导 | 108 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome FGFR配体结合和激活 | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome FGFR4配体结合和激活 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR的Reactome信号传导 | 112 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PI3K级联 | 71 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向神经上皮 | 176 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移 | 344 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼头颈癌 | 100 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌11q12 Q14 Amplicon | 158 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血干细胞长期 | 302 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN | 373 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林黑色素瘤复制号码 | 73 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Labbe TGFB1靶向DN | 108 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼不成熟到成熟的B淋巴细胞 | 43 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 142 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 210 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vandesluis Commd1目标2组 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA分泌因素 | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |