基因页:NR1H4
概括?
基因 | 9971 |
象征 | NR1H4 |
同义词 | bar | fxr | hrr-1 | hrr1 | rip14 |
描述 | 核受体亚家族1组成员4 |
参考 | MIM:603826|HGNC:HGNC:7967|Ensembl:ENSG0000000012504|HPRD:04827|Vega:Otthumg00000170359 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12q23.1 |
Pascal P值 | 0.017 |
胎儿β | -0.131 |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NR1H4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ythdf3 | 0.96 | 0.98 |
Spin1 | 0.95 | 0.96 |
MTMR9 | 0.95 | 0.97 |
KPNA1 | 0.94 | 0.97 |
C5orf24 | 0.94 | 0.96 |
ETNK1 | 0.94 | 0.96 |
SCAMP1 | 0.94 | 0.96 |
AVL9 | 0.94 | 0.96 |
NAT12 | 0.94 | 0.96 |
FAM160B1 | 0.94 | 0.96 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FXYD1 | -0.71 | -0.80 |
MT-CO2 | -0.68 | -0.79 |
AF347015.31 | -0.67 | -0.77 |
higd1b | -0.66 | -0.78 |
HSD17B14 | -0.66 | -0.72 |
AF347015.33 | -0.65 | -0.74 |
AC018755.7 | -0.65 | -0.70 |
mt-cyb | -0.65 | -0.75 |
AF347015.8 | -0.65 | -0.77 |
TLCD1 | -0.65 | -0.74 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Biocarta核途径 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID RXR VDR途径 | 26 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Puiffe入侵被腹水DN抑制 | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Affar YY1靶向DN | 234 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
卫星对干扰素βdn的响应 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27me3 | 196 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠和直肠癌DN | 101 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西部肾上腺皮质肿瘤 | 294 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Firestein增殖 | 175 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja Islet HNF1A靶向DN | 109 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja肝HNF1A靶向DN | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |