概括
基因 9971
象征 NR1H4
同义词 bar | fxr | hrr-1 | hrr1 | rip14
描述 核受体亚家族1组成员4
参考 MIM:603826|HGNC:HGNC:7967|Ensembl:ENSG0000000012504|HPRD:04827|Vega:Otthumg00000170359
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12q23.1
Pascal P值 0.017
胎儿β -0.131
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ythdf3 0.96 0.98
Spin1 0.95 0.96
MTMR9 0.95 0.97
KPNA1 0.94 0.97
C5orf24 0.94 0.96
ETNK1 0.94 0.96
SCAMP1 0.94 0.96
AVL9 0.94 0.96
NAT12 0.94 0.96
FAM160B1 0.94 0.96
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FXYD1 -0.71 -0.80
MT-CO2 -0.68 -0.79
AF347015.31 -0.67 -0.77
higd1b -0.66 -0.78
HSD17B14 -0.66 -0.72
AF347015.33 -0.65 -0.74
AC018755.7 -0.65 -0.70
mt-cyb -0.65 -0.75
AF347015.8 -0.65 -0.77
TLCD1 -0.65 -0.74

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Biocarta核途径 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID RXR VDR途径 26 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Puiffe入侵被腹水DN抑制 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO肝特异性基因 244 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1靶向DN 234 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卫星对干扰素βdn的响应 52 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3 196 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌DN 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质肿瘤 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Firestein增殖 175 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja Islet HNF1A靶向DN 109 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向DN 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因