基因页:thoc1
概括?
基因 | 9984 |
象征 | thoc1 |
同义词 | HPR1 | P84 | P84N5 |
描述 | 综合体1 |
参考 | MIM:606930|HGNC:HGNC:19070|Ensembl:ENSG0000000079134|HPRD:09498|Vega:Otthumg00000178051 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 18p11.32 |
Pascal P值 | 0.098 |
Sherlock P值 | 0.074 |
胎儿β | 1.223 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG18851521 | 18 | 268131 | thoc1 | 4.211E-4 | -0.19 | 0.045 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/THOC1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ank2 | 0.87 | 0.93 |
LPIN2 | 0.86 | 0.90 |
KIAA0317 | 0.85 | 0.89 |
cacna1c | 0.85 | 0.90 |
RGMB | 0.85 | 0.90 |
cacna1b | 0.84 | 0.89 |
NRXN1 | 0.84 | 0.89 |
LARP4B | 0.84 | 0.91 |
AC099524.1 | 0.84 | 0.88 |
HGSNAT | 0.84 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.67 | -0.71 |
MT-CO2 | -0.66 | -0.72 |
FXYD1 | -0.66 | -0.68 |
AC021016.1 | -0.64 | -0.70 |
AF347015.33 | -0.64 | -0.66 |
AF347015.21 | -0.64 | -0.74 |
higd1b | -0.64 | -0.72 |
AF347015.8 | -0.63 | -0.70 |
mt-cyb | -0.63 | -0.66 |
COPZ2 | -0.63 | -0.65 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg剪接体 | 128 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Puiffe入侵被腹水DN抑制 | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Deurig t细胞促进性白血病DN | 320 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向 | 191 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应240 HELA | 60 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
按拷贝数量的丁肺癌表达 | 100 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Okumura炎症反应LPS | 183 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 | 143 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染20小时 | 240 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 | 163 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标 | 212 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kyng DNA损坏紫外线 | 62 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CADWELL ATG16L1靶向DN | 70 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bredemeyer抹布发信号不是通过ATM提高 | 62 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng Werner综合征和正常老化DN | 225 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |