概括
基因 9985
象征 rec8
同义词 hr21spb | rec8l1 | rec8p
描述 REC8减数分裂重组蛋白
参考 MIM:608193|HGNC:HGNC:16879|Ensembl:ENSG00000100918|HPRD:09739|Vega:Otthumg00000171916
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q12
Pascal P值 0.154
Sherlock P值 0.187
胎儿β 2.191
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.047
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 rec8 9985 5.229e-8 反式
RS3845734 CHR2 171125572 rec8 9985 0 反式
RS17762315 CHR5 76807576 rec8 9985 0.07 反式
RS16878317 CHR8 31657853 rec8 9985 0.14 反式
RS4075663 Chr11 18793398 rec8 9985 0.15 反式
RS16955618 CHR15 29937543 rec8 9985 1.67e-11 反式
RS1041786 CHR21 22617710 rec8 9985 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
P4HB 0.91 0.89
COPB2 0.90 0.88
PDIA4 0.89 0.90
卡尔 0.89 0.87
CSTF2T 0.88 0.87
SMU1 0.87 0.84
G3BP1 0.87 0.86
BZW1 0.87 0.87
DDB1 0.87 0.85
HSPD1 0.87 0.83
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.70 -0.77
AF347015.33 -0.69 -0.76
AF347015.27 -0.68 -0.76
FXYD1 -0.68 -0.75
AF347015.31 -0.68 -0.76
AF347015.8 -0.68 -0.76
AF347015.21 -0.67 -0.72
mt-cyb -0.64 -0.73
AF347015.15 -0.63 -0.74
AF347015.2 -0.63 -0.73

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007131 相互减数分裂重组 塔斯 10207075
去:0007283 精子发生 塔斯 10207075
去:0007062 姐妹染色单体凝聚力 塔斯 10207075
去:0007126 减数分裂 塔斯 10207075
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0000228 核染色体 IEA -
去:0000800 横向元素 IEA -
去:0005634 塔斯 10207075

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg卵母细胞减数分裂 114 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome减数分裂 116 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞周期 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome染色体维护 122 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Meiotic Synapsis 73 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN 199 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王HCP前列腺癌 111 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 126 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部 120 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
恩格曼癌祖细胞dn 70 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
韦伯甲基化的HCP成纤维细胞DN 42 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
精子中的韦伯甲基化的HCP 20 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk减数分裂和DNA修复 39 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATZUK精子细胞 72 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 228 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向DN 242 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向 221 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因