基因页:rec8
概括?
基因 | 9985 |
象征 | rec8 |
同义词 | hr21spb | rec8l1 | rec8p |
描述 | REC8减数分裂重组蛋白 |
参考 | MIM:608193|HGNC:HGNC:16879|Ensembl:ENSG00000100918|HPRD:09739|Vega:Otthumg00000171916 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q12 |
Pascal P值 | 0.154 |
Sherlock P值 | 0.187 |
胎儿β | 2.191 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.047 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | rec8 | 9985 | 5.229e-8 | 反式 | ||
RS3845734 | CHR2 | 171125572 | rec8 | 9985 | 0 | 反式 | ||
RS17762315 | CHR5 | 76807576 | rec8 | 9985 | 0.07 | 反式 | ||
RS16878317 | CHR8 | 31657853 | rec8 | 9985 | 0.14 | 反式 | ||
RS4075663 | Chr11 | 18793398 | rec8 | 9985 | 0.15 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | rec8 | 9985 | 1.67e-11 | 反式 | ||
RS1041786 | CHR21 | 22617710 | rec8 | 9985 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/REC8_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
P4HB | 0.91 | 0.89 |
COPB2 | 0.90 | 0.88 |
PDIA4 | 0.89 | 0.90 |
卡尔 | 0.89 | 0.87 |
CSTF2T | 0.88 | 0.87 |
SMU1 | 0.87 | 0.84 |
G3BP1 | 0.87 | 0.86 |
BZW1 | 0.87 | 0.87 |
DDB1 | 0.87 | 0.85 |
HSPD1 | 0.87 | 0.83 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.70 | -0.77 |
AF347015.33 | -0.69 | -0.76 |
AF347015.27 | -0.68 | -0.76 |
FXYD1 | -0.68 | -0.75 |
AF347015.31 | -0.68 | -0.76 |
AF347015.8 | -0.68 | -0.76 |
AF347015.21 | -0.67 | -0.72 |
mt-cyb | -0.64 | -0.73 |
AF347015.15 | -0.63 | -0.74 |
AF347015.2 | -0.63 | -0.73 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007131 | 相互减数分裂重组 | 塔斯 | 10207075 | |
去:0007283 | 精子发生 | 塔斯 | 10207075 | |
去:0007062 | 姐妹染色单体凝聚力 | 塔斯 | 10207075 | |
去:0007126 | 减数分裂 | 塔斯 | 10207075 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0000228 | 核染色体 | IEA | - | |
去:0000800 | 横向元素 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | 塔斯 | 10207075 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg卵母细胞减数分裂 | 114 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome减数分裂 | 116 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome染色体维护 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Meiotic Synapsis | 73 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN | 199 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王HCP前列腺癌 | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标 | 126 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV全部 | 120 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV 24小时 | 93 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
恩格曼癌祖细胞dn | 70 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
韦伯甲基化的HCP成纤维细胞DN | 42 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
精子中的韦伯甲基化的HCP | 20 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk减数分裂和DNA修复 | 39 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MATZUK精子细胞 | 72 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 | 228 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向DN | 242 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向 | 221 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |