基因页面:KCNE2

总结吗?
GeneID 9992年
象征 KCNE2
同义词 ATFB4 | LQT5 | LQT6 | MIRP1
描述 电压门控钾通道亚E调节亚基2
参考 MIM: 603796|HGNC: HGNC: 6242|HPRD: 04813|
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 21 q22.12
帕斯卡假定值 0.767
胎儿β 0.212
eGene 迈尔斯的顺式和反式
支持 兴奋性

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
表达式 荟萃分析的基因表达 P值:2.507
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息

部分即遗传学和表观遗传学注释

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs11701963 chr21 35323656 KCNE2 9992年 0.18 独联体

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
YTHDF2 0.97 0.96
PAK2 0.96 0.96
NUP160 0.96 0.92
HSDL1 0.96 0.97
SPAST 0.96 0.97
叫做PBRM1 0.96 0.97
ZNF776 0.96 0.96
ZNF606 0.96 0.93
PRRC1 0.96 0.96
MIER3 0.96 0.96
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.74 -0.81
AIFM3 -0.73 -0.80
C5orf53 -0.73 -0.78
FXYD1 -0.72 -0.91
MT-CO2 -0.72 -0.91
S100B -0.72 -0.85
AF347015.31 -0.71 -0.88
AF347015.33 -0.71 -0.87
TSC22D4 -0.71 -0.81
AF347015.27 -0.70 -0.86

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005244 电压门控离子通道的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0005249 电压门控钾离子通道的活动 助教 10219239
去:0030955 钾离子结合 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0008015 血液循环 NAS 10219239
去:0008016 调节心脏收缩 助教 10219239
去:0006811 离子传输 国际能源机构 - - - - - -
去:0006813 钾离子运输 助教 10219239
去:0006936 肌肉收缩 助教 10219239
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005764 溶酶体 艾达 16780588
去:0016021 不可或缺的膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0005886 等离子体膜 艾达 16780588
去:0008076 电压门控钾通道复杂 助教 10219239

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
VECCHI胃癌早期DN 367年 220年 所有SZGR 2.0基因通路
LEIN脉络丛标记 103年 61年 所有SZGR 2.0基因通路
ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 1725年 838年 所有SZGR 2.0基因通路