基因页面:DGCR2

总结吗?
GeneID 9993年
象征 DGCR2
同义词 兰DGS-C | IDD | | SEZ-12
描述 迪格奥尔格综合征临界区基因2
参考 MIM: 600594|HGNC: HGNC: 2845|运用:ENSG00000070413|HPRD: 08999|织女:OTTHUMG00000150141
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 22 q11.21
帕斯卡假定值 0.011
夏洛克假定值 0.962
这样假定值 0.014
胎儿β -0.678
eGene 尾状基底神经节
皮质
额叶皮质BA9
下丘脑
伏隔核基底神经节
元
支持 CompositeSet
达内尔FMRP目标

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异的研究 人工管理
简历:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症GWASdb记录
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
认为:Xu_2012 全外显子组测序分析 新创4基因的突变的外显子组测序鉴定了795个样本
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
协会 综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究 3 链接到SZGene
GSMA_I 基因组扫描分析 Psr: 0.031
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 点击显示详细信息

部分即遗传学和表观遗传学注释

@认为表

基因 染色体 位置 裁判 Alt 成绩单 AA变化 突变类型 筛选 CG46 特征 研究
DGCR2 chr22 19028681 G C NM_001173533
NM_001173534
NM_001184781
NM_005137
NR_033674		 p.388P > R
p.385P > R
p.426P > R
p.429P > R
。		 错义
错义
错义
错义
npcRNA		 精神分裂症 认为:Xu_2012


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
NDFIP1 0.85 0.87
RAB18 0.84 0.85
VAPA 0.84 0.85
DCK 0.84 0.85
TRUB1 0.84 0.86
MORF4L2 0.84 0.85
PPP1CB 0.84 0.83
DNAJA2 0.83 0.84
PPP2CA 0.83 0.83
COPS8 0.83 0.84
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.26 -0.57 -0.48
AF347015.2 -0.56 -0.46
AF347015.8 -0.54 -0.47
AF347015.18 -0.54 -0.49
MT-CO2 -0.53 -0.47
AF347015.15 -0.53 -0.46
MT-CYB -0.52 -0.47
MICALL2 -0.52 -0.55
GPT -0.52 -0.51
AF347015.33 -0.51 -0.46

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0004872 受体的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0005529 糖绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0005488 绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0005515 蛋白结合 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0007155 细胞粘附 国际能源机构 - - - - - -
去:0009887 器官形态发生 助教 7655455
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0016020 膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0016021 不可或缺的膜 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
ONKEN葡萄膜黑色素瘤了 783年 507年 所有SZGR 2.0基因通路
周炎症反应生活的DN 384年 220年 所有SZGR 2.0基因通路
迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 1382年 904年 所有SZGR 2.0基因通路
DN SENESE HDAC3目标 536年 332年 所有SZGR 2.0基因通路
TIEN肠道益生菌24小时 557年 331年 所有SZGR 2.0基因通路
周炎症反应费马DN 284年 156年 所有SZGR 2.0基因通路
金正日WT1 DN的目标 459年 276年 所有SZGR 2.0基因通路
多德鼻咽癌起来 1821年 933年 所有SZGR 2.0基因通路
CHIARADONNA肿瘤转化喀斯特DN 142年 95年 所有SZGR 2.0基因通路
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 1781年 1082年 所有SZGR 2.0基因通路
GRAESSMANN MC和阿霉素DN 770年 415年 所有SZGR 2.0基因通路
帕蒂尔肝癌 747年 453年 所有SZGR 2.0基因通路
胎儿肝脏DN MARTORIATI MDM4目标 514年 319年 所有SZGR 2.0基因通路
木头EBV EBNA1目标 110年 71年 所有SZGR 2.0基因通路
廖转移 539年 324年 所有SZGR 2.0基因通路
SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN 514年 330年 所有SZGR 2.0基因通路
鲜明的前额叶皮层22 q11删除DN 517年 309年 所有SZGR 2.0基因通路
斯塔克HYPPOCAMPUS 22 q11删除DN 20. 19 所有SZGR 2.0基因通路
伊万诺娃造血干细胞 254年 164年 所有SZGR 2.0基因通路
李卡路里限制肌肉DN 51 28 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯RB1目标了 673年 430年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯TP53的目标了 602年 364年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯RB1和TP53的目标 601年 369年 所有SZGR 2.0基因通路
布卢姆应对SALIRASIB DN 342年 220年 所有SZGR 2.0基因通路
陈代谢症侯群网络 1210年 725年 所有SZGR 2.0基因通路
米利伪足趋化性DN 457年 302年 所有SZGR 2.0基因通路
米利伪足趋触性DN 668年 419年 所有SZGR 2.0基因通路
八木AML和T 8 21易位 368年 247年 所有SZGR 2.0基因通路
若林史江脂肪生成PPARG 8 d 658年 397年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 101 2442年 2448年 1 hsa - mir - 101 UACAGUACUGUGAUAACUGAAG
mir - 144 2441年 2448年 1、m8 hsa - mir - 144 UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG
mir - 182 2555年 2561年 1 hsa - mir - 182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
mir - 183 904年 911年 1、m8 hsa - mir - 183 UAUGGCACUGGUAGAAUUCACUG
mir - 203.1 2542年 2548年 1 hsa - mir - 203 UGAAAUGUUUAGGACCACUAG
mir - 342 2533年 2539年 1 hsa - mir - 342大脑 UCUCACACAGAAAUCGCACCCGUC
mir - 96 2555年 2561年 1 hsa - mir - 96大脑 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC