概括
基因 9994
象征 CASP8AP2
同义词 CED-4 | Flash | RIP25
描述 caspase 8相关蛋白2
参考 MIM:606880|HGNC:HGNC:1510|ENSEMBL:ENSG00000118412|HPRD:06048|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q15
Pascal P值 0.27
Sherlock P值 0.912
胎儿β 0.411
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG25887294 6 90539239 CASP8AP2 4.2e-8 -0.017 1.17E-5 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2197597 CHR2 129638077 CASP8AP2 9994 0.09 反式
RS16829545 CHR2 151977407 CASP8AP2 9994 2.877E-4 反式
RS7584986 CHR2 184111432 CASP8AP2 9994 0.1 反式
RS17029291 CHR3 32402138 CASP8AP2 9994 0.11 反式
RS1324669 CHR13 107872446 CASP8AP2 9994 0.16 反式
RS16955618 CHR15 29937543 CASP8AP2 9994 9.678E-4 反式
RS1761450 CHR19 54818034 CASP8AP2 9994 0.1 反式
RS9637082 CHR21 21213235 CASP8AP2 9994 0.03 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Pick1 0.90 0.90
DDX41 0.89 0.90
ZNF653 0.89 0.90
ANAPC2 0.88 0.88
EGLN2 0.88 0.89
Spire2 0.87 0.90
BRF1 0.87 0.90
PPAN-P2RY11 0.86 0.87
ppan 0.86 0.87
LONP1 0.86 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.73 -0.73
AF347015.27 -0.70 -0.73
AF347015.21 -0.70 -0.73
MT-CO2 -0.70 -0.71
AF347015.33 -0.69 -0.70
AF347015.8 -0.68 -0.71
mt-cyb -0.68 -0.69
AF347015.2 -0.65 -0.69
AF347015.15 -0.65 -0.69
鼻孔 -0.63 -0.64

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
SA编程的细胞死亡 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St FAS信号通路 65 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PYEON HPV阳性肿瘤 98 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌群集1 121 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性LOF DN 228 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAL PRMT5靶向 203 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成12 36 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
de yy1靶向DN 92 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
植洛小儿所有疗法反应dn 29 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36小时DN 185 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时DN 277 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标DN 89 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PYEON CANCAR CANCAR HEAD和NECK与颈椎 193 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G1 S 147 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应很晚 317 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因