基因页:CASP8AP2
概括?
基因 | 9994 |
象征 | CASP8AP2 |
同义词 | CED-4 | Flash | RIP25 |
描述 | caspase 8相关蛋白2 |
参考 | MIM:606880|HGNC:HGNC:1510|ENSEMBL:ENSG00000118412|HPRD:06048| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q15 |
Pascal P值 | 0.27 |
Sherlock P值 | 0.912 |
胎儿β | 0.411 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG25887294 | 6 | 90539239 | CASP8AP2 | 4.2e-8 | -0.017 | 1.17E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2197597 | CHR2 | 129638077 | CASP8AP2 | 9994 | 0.09 | 反式 | ||
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | CASP8AP2 | 9994 | 2.877E-4 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | CASP8AP2 | 9994 | 0.1 | 反式 | ||
RS17029291 | CHR3 | 32402138 | CASP8AP2 | 9994 | 0.11 | 反式 | ||
RS1324669 | CHR13 | 107872446 | CASP8AP2 | 9994 | 0.16 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | CASP8AP2 | 9994 | 9.678E-4 | 反式 | ||
RS1761450 | CHR19 | 54818034 | CASP8AP2 | 9994 | 0.1 | 反式 | ||
RS9637082 | CHR21 | 21213235 | CASP8AP2 | 9994 | 0.03 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CASP8AP2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Pick1 | 0.90 | 0.90 |
DDX41 | 0.89 | 0.90 |
ZNF653 | 0.89 | 0.90 |
ANAPC2 | 0.88 | 0.88 |
EGLN2 | 0.88 | 0.89 |
Spire2 | 0.87 | 0.90 |
BRF1 | 0.87 | 0.90 |
PPAN-P2RY11 | 0.86 | 0.87 |
ppan | 0.86 | 0.87 |
LONP1 | 0.86 | 0.85 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.73 | -0.73 |
AF347015.27 | -0.70 | -0.73 |
AF347015.21 | -0.70 | -0.73 |
MT-CO2 | -0.70 | -0.71 |
AF347015.33 | -0.69 | -0.70 |
AF347015.8 | -0.68 | -0.71 |
mt-cyb | -0.68 | -0.69 |
AF347015.2 | -0.65 | -0.69 |
AF347015.15 | -0.65 | -0.69 |
鼻孔 | -0.63 | -0.64 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
SA编程的细胞死亡 | 12 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
St FAS信号通路 | 65 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PYEON HPV阳性肿瘤 | 98 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌群集1 | 121 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1急性LOF DN | 228 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌基础与仙女 | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAL PRMT5靶向 | 203 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成12 | 36 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
de yy1靶向DN | 92 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib dn的Blum响应 | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
植洛小儿所有疗法反应dn | 29 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标36小时DN | 185 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时DN | 277 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标DN | 89 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PYEON CANCAR CANCAR HEAD和NECK与颈椎 | 193 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期G1 S | 147 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |