基因页面:ADAM19

总结吗?
GeneID 8728年
象征 ADAM19
同义词 FKSG34 | MADDAM | MLTNB
描述 亚当metallopeptidase域19
参考 MIM: 603640|HGNC: HGNC: 197|运用:ENSG00000135074|HPRD: 04704|织女:OTTHUMG00000130242
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 5 q33.3
帕斯卡假定值 0.386
夏洛克假定值 0.399
胎儿β 0.726
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:GWAScat 全基因组关联研究 这个数据集包含560个snp与精神分裂症有关。总共有486个基因映射到这些snp在50 kb。
简历:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症GWASdb记录
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
简历:PheWAS Phenome-wide协会研究(PheWAS) 157个snp与精神分裂症有关 1
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 1
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
GSMA_I 基因组扫描分析 Psr: 0.0032
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) Psr: 0.00459
GSMA_IIE 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) Psr: 0.01718
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息
网络 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 贡献在PPI网络最短路径:1.1741

部分即遗传学和表观遗传学注释

@简历:PheWAS

SNP ID 染色体 位置 等位基因 P 函数 基因 上/下距离
rs2277027 5 156932376 零 1.553 ADAM19 零

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg17395226 5 156887490 ADAM19 3.3 e-9 -0.031 2.2 e-6 DMG: Jaffe_2016

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs6753473 chr2 26526418 ADAM19 8728年 0.05 反式
rs16829545 chr2 151977407 ADAM19 8728年 0.12 反式
rs16827037 chr3 117203284 ADAM19 8728年 0.07 反式
rs16872030 chr8 105937366 ADAM19 8728年 0.1 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
KDM5B 0.97 0.97
ATF7IP 0.96 0.97
RFX7 0.96 0.96
ZNF616 0.96 0.96
叫做PBRM1 0.96 0.96
KDM1 0.95 0.96
KHDRBS1 0.95 0.98
UBTD2 0.95 0.95
OXSR1 0.95 0.95
PRRC1 0.95 0.94
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.73 -0.83
C5orf53 -0.72 -0.78
AIFM3 -0.71 -0.81
PTH1R -0.69 -0.77
ALDOC -0.69 -0.73
FBXO2 -0.69 -0.68
AF347015.31 -0.69 -0.91
S100B -0.69 -0.85
AF347015.27 -0.69 -0.89
TSC22D4 -0.69 -0.82

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0004222 metalloendopeptidase活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0008270 锌离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0017124 SH3域绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0008233 肽酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0046872 金属离子结合 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006508 蛋白水解作用 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0016020 膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0016021 不可或缺的膜 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
父母MTOR信号DN 46 29日 所有SZGR 2.0基因通路
中村肿瘤区外围和中心 285年 181年 所有SZGR 2.0基因通路
通过CD40 HOLLMANN细胞凋亡 201年 125年 所有SZGR 2.0基因通路
SCHUETZ乳腺癌导管侵入性 351年 230年 所有SZGR 2.0基因通路
开回应前列腺素E2 146年 86年 所有SZGR 2.0基因通路
DAVICIONI PAX FOXO1融合的目标 255年 177年 所有SZGR 2.0基因通路
FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人 579年 346年 所有SZGR 2.0基因通路
武田的目标NUP98 HOXA9融合8 d DN 205年 127年 所有SZGR 2.0基因通路
武田的目标NUP98 HOXA9融合16 d 175年 108年 所有SZGR 2.0基因通路
SENESE HDAC3目标了 501年 327年 所有SZGR 2.0基因通路
金正日WT1目标8小时 164年 122年 所有SZGR 2.0基因通路
CHIARADONNA肿瘤转化喀斯特 126年 72年 所有SZGR 2.0基因通路
转换CDC25 CHIARADONNA肿瘤 120年 73年 所有SZGR 2.0基因通路
林格伦膀胱癌集群1 DN 378年 231年 所有SZGR 2.0基因通路
林格伦膀胱癌集群2 b 392年 251年 所有SZGR 2.0基因通路
林格伦膀胱癌复发率高 49 31日 所有SZGR 2.0基因通路
EBAUER目标PAX3 FOXO1融合DN 48 31日 所有SZGR 2.0基因通路
DN SCHLOSSER血清反应 712年 443年 所有SZGR 2.0基因通路
LA即目标 24 15 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652年 1023年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA ATM PCC网络 1442年 892年 所有SZGR 2.0基因通路
LEI HOXC8 DN的目标 17 13 所有SZGR 2.0基因通路
甜蜜的喀斯特目标了 84年 51 所有SZGR 2.0基因通路
彭谷氨酰胺剥夺DN 337年 230年 所有SZGR 2.0基因通路
桑塞姆APC DN的目标 366年 238年 所有SZGR 2.0基因通路
郭十六进制目标DN 65年 36 所有SZGR 2.0基因通路
康被叔DN 102年 67年 所有SZGR 2.0基因通路
郑受FOXP3 491年 310年 所有SZGR 2.0基因通路
海勒通过甲基化沉默了 282年 183年 所有SZGR 2.0基因通路
由喀斯特IWANAGA致癌PTEN 181年 112年 所有SZGR 2.0基因通路
射线能够以ERBB2 CDC25A 104年 57 所有SZGR 2.0基因通路
BOYLAN多发性骨髓瘤D集群DN 40 26 所有SZGR 2.0基因通路
RUTELLA CSF2RB和IL4 338年 225年 所有SZGR 2.0基因通路
RUTELLA应对HGF DN 235年 144年 所有SZGR 2.0基因通路
RUTELLA HGF VS CSF2RB和IL4 DN 245年 150年 所有SZGR 2.0基因通路
甜蜜的肺癌喀斯特 491年 316年 所有SZGR 2.0基因通路
陈代谢症侯群网络 1210年 725年 所有SZGR 2.0基因通路
BOYLAN多发性骨髓瘤PCA3 DN 69年 38 所有SZGR 2.0基因通路
詹多发性骨髓瘤CD1 DN 45 30. 所有SZGR 2.0基因通路
经典VERHAAK胶质母细胞瘤 162年 122年 所有SZGR 2.0基因通路
国外RB1目标融合性的 567年 365年 所有SZGR 2.0基因通路
MIYAGAWA EWSR1 ETS融合DN的目标 229年 135年 所有SZGR 2.0基因通路
WIEDERSCHAIN BMI1和PCGF2的目标 57 39 所有SZGR 2.0基因通路
KOINUMA SMAD2或SMAD3的目标 824年 528年 所有SZGR 2.0基因通路
王MLL目标 289年 188年 所有SZGR 2.0基因通路
福斯特KDM1A目标了 266年 142年 所有SZGR 2.0基因通路
RAO受SALL4同种型 182年 108年 所有SZGR 2.0基因通路
黄宗泽TH1细胞毒性模块 114年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
ALTEMEIER响应与机械通气有限合伙人 128年 81年 所有SZGR 2.0基因通路
杜兰基质年代了 297年 194年 所有SZGR 2.0基因通路
NABA ECM监管机构 238年 125年 所有SZGR 2.0基因通路
NABA MATRISOME相关 753年 411年 所有SZGR 2.0基因通路
NABA MATRISOME 1028年 559年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-124/506 3586年 3592年 m8 hsa - mir - 506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
hsa - mir - 124大脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir - 128 2222年 2228年 1 hsa - mir - 128 a UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU
hsa - mir - 128 b UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC
mir - 145 3327年 3334年 1、m8 hsa - mir - 145 GUCCAGUUUUCCCAGGAAUCCCUU
mir - 153 3559年 3566年 1、m8 hsa - mir - 153 UUGCAUAGUCACAAAAGUGA
miR-23 3465年 3472年 1、m8 hsa-miR-23a大脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC
hsa-miR-23b大脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUACC
miR-25/32/92/363/367 222年 229年 1、m8 hsa-miR-25大脑 CAUUGCACUUGUCUCGGUCUGA
hsa-miR-32 UAUUGCACAUUACUAAGUUGC
hsa - mir - 92 UAUUGCACUUGUCCCGGCCUG
hsa - mir - 367 AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA
hsa - mir - 92 b深圳 UAUUGCACUCGUCCCGGCCUC
miR-26 3569年 3576年 1、m8 hsa-miR-26a大脑 UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC
hsa-miR-26b深圳 UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
miR-27 2222年 2229年 1、m8 hsa-miR-27a大脑 UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC
hsa-miR-27b大脑 UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC
miR-29 832年 838年 m8 hsa-miR-29a深圳 UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU
hsa-miR-29b深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
hsa-miR-29c深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCGGU
hsa-miR-29a深圳 UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU
hsa-miR-29b深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
hsa-miR-29c深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCGGU
miR-30-5p 3539年 3546年 1、m8 hsa-miR-30a-5p UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
hsa-miR-30c大脑 UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
hsa-miR-30d深圳 UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
hsa-miR-30b深圳 UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
hsa-miR-30e-5p UGUAAACAUCCUUGACUGGA
mir - 323 3465年 3471年 1 hsa - mir - 323大脑 GCACAUUACACGGUCGACCUCU
mir - 378 1748年 1754年 1 hsa - mir - 378 CUCCUGACUCCAGGUCCUGUGU
mir - 448 3560年 3566年 1 hsa - mir - 448 UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU