基因页面:APOPT1
总结吗?
| GeneID | 84334年 |
| 象征 | APOPT1 |
| 同义词 | APOP | APOP1 | C14orf153 |
| 描述 | apoptogenic 1,线粒体 |
| 参考 | MIM: 616003|HGNC: HGNC: 20492|运用:ENSG00000256053|HPRD: 12637|织女:OTTHUMG00000153929 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 14 q32.33 |
| 夏洛克假定值 | 0.906 |
| eGene | 硬膜基底神经节 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWAScat | 全基因组关联研究 | 这个数据集包含560个snp与精神分裂症有关。总共有486个基因映射到这些snp在50 kb。 | |
| 简历:PGC128 | 全基因组关联研究 | 一个多阶段精神分裂症GWAS的36989例和113075控制。包括精神分裂症工作组的报告。128年独立协会跨越108位点 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
简历:PGC128
简历:PGC128| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | P | 函数 | 基因 | 上/下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs12887734 | chr14 | 104046834 | TG | 1.172 e-13 | intronic | APOPT1 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2372020 | chr7 | 83668573 | C14orf153 | 84334年 | 0.14 | 反式 | ||
| snp_a - 4294991 | 0 | C14orf153 | 84334年 | 0.07 | 反式 | |||
| rs11793484 | chr9 | 317239年 | C14orf153 | 84334年 | 0.03 | 反式 | ||
| rs10970457 | chr9 | 326183年 | C14orf153 | 84334年 | 0.03 | 反式 | ||
| rs12255258 | chr10 | 106306927 | C14orf153 | 84334年 | 0.08 | 反式 | ||
| rs6529624 | chrX | 133499961 | C14orf153 | 84334年 | 0.06 | 反式 | ||
| rs11160752 | 14 | 103992096 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 3.188 e-6 | 0 | -37412年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2296487 | 14 | 103996205 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 1.587 e-6 | 0 | -33303年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2756138 | 14 | 103996733 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 1.558 e-6 | 0 | -32775年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2021965 | 14 | 103997248 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 1.54 e-6 | 0 | -32260年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12891288 | 14 | 103999750 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 2.924 e - | 0 | -29758年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2236281 | 14 | 104000518 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 1.449 e-6 | 0 | -28990年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7161305 | 14 | 104002234 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 2.101 e-6 | 0 | -27274年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs34235720 | 14 | 104004968 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 2.262 e-6 | 0 | -24540年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12880077 | 14 | 104006342 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 8.068 e - | 0 | -23166年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12880224 | 14 | 104006414 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 1.131 e-6 | 0 | -23094年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9324063 | 14 | 104006693 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 3.818 e - | 0 | -22815年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12147596 | 14 | 104006716 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 1.122 e-6 | 0 | -22792年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12891360 | 14 | 104008159 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 2.092 e - | 0 | -21349年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs34633710 | 14 | 104009630 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 3.169 e-6 | 0 | -19878年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2403194 | 14 | 104011429 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 2.748 e - | 0 | -18079年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12893668 | 14 | 104017793 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 1.27 e-6 | 0 | -11715年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12147645 | 14 | 104100208 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 5.118 e - | 0 | 70700年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs8021229 | 14 | 104157578 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 1.706 e-6 | 0 | 128070年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs59092643 | 14 | 104169988 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 1.459 e-6 | 0 | 140480年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs35311561 | 14 | 104188127 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 9.84 e - | 0 | 158619年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12894657 | 14 | 104188920 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 1.823 e-6 | 0 | 159412年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs56168984 | 14 | 104189857 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 8.93 e - | 0 | 160349年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7143885 | 14 | 104191917 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 1.364 e-6 | 0 | 162409年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2295148 | 14 | 104195610 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 3.053 e-6 | 0 | 166102年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12433009 | 14 | 104196405 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 3.065 e-6 | 0 | 166897年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3742366 | 14 | 104198351 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 2.342 e-6 | 0 | 168843年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs8548 | 14 | 104199580 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 3.278 e-6 | 0 | 170072年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7142769 | 14 | 104228841 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 3.396 e-6 | 0 | 199333年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12888002 | 14 | 104238647 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 1.046 e-6 | 0 | 209139年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs58948234 | 14 | 104325846 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 6.492 e - | 0 | 296338年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12891477 | 14 | 104332759 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 1.604 e-6 | 0 | 303251年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6576009 | 14 | 104335229 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 2.729 e-6 | 0 | 305721年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10132641 | 14 | 104338258 | APOPT1 | ENSG00000256053.3 | 8.944 e-8 | 0 | 308750年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人DN | 463年 | 290年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MARTORIATI MDM4目标胎儿肝脏 | 227年 | 137年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DAIRKEE叔目标了 | 380年 | 213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH OCT4目标 | 290年 | 172年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃晚期造血祖 | 544年 | 307年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| IWANAGA致癌的喀斯特 | 170年 | 107年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YAUCH刺猬信号旁分泌 | 149年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOYLAN多发性骨髓瘤D | 89年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |