基因页：CNOT1

概括？
基因 23019
象征 CNOT1
同义词 ad-005 | cdc39 | not1 | not1h
描述 ccr4-not转录复合物亚基1
参考 MIM：604917|HGNC：HGNC：7877|ENSEMBL：ENSG00000125107|HPRD：11999|Vega：Otthumg00000133487
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16Q21
Pascal P值 1.962E-7
Sherlock P值 0.388
胎儿β 1.389
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
简历：PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历：PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS12325245 CHR16 58681393 在 1.149E-8 基因间 CNOT1，SLC38A7 dist = 17603; dist = 17620

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG06482535 16 58594333 cnot1; snora50 2.859E-4 0.312 0.039 DMG：Wockner_2014
CG23761196 16 58664510 CNOT1 -0.038 0.48 DMG：Nishioka_2013


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA0427 0.94 0.95
Arhgef18 0.92 0.94
ZNF592 0.92 0.92
Rapgef1 0.92 0.94
Neurl4 0.92 0.92
FOXK2 0.92 0.92
mllt1 0.91 0.94
SLC35E1 0.91 0.91
MCF2L 0.91 0.93
clip2 0.91 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.76 -0.80
MT-CO2 -0.73 -0.78
AF347015.21 -0.73 -0.83
higd1b -0.71 -0.77
FXYD1 -0.70 -0.75
AF347015.27 -0.70 -0.76
COPZ2 -0.69 -0.73
mt-cyb -0.69 -0.74
AF347015.33 -0.69 -0.72
C1orf54 -0.69 -0.83

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
KeGG RNA降解 59 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
渡边直肠癌放疗反应能力 108 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roylance乳腺癌16Q复制号码 63 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA PERIFERAL CHICK 169 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin DN的反应 249 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Thillainadesan Znf217靶向 44 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成pparg rxra绑定36小时 152 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因