基因页面:CPSF2
总结吗?
GeneID | 53981年 |
象征 | CPSF2 |
同义词 | CPSF100 |
描述 | 乳沟和聚腺苷酸化特定因素2 |
参考 | MIM: 606028|HGNC: HGNC: 2325|HPRD: 05824| |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 14 q31.1 |
帕斯卡假定值 | 0.3 |
夏洛克假定值 | 0.769 |
胎儿β | 0.252 |
eGene | 尾状基底神经节 小脑 皮质 海马体 伏隔核基底神经节 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
简历:PheWAS | Phenome-wide协会研究(PheWAS) | 157个snp与精神分裂症有关 | 0 |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
简历:PheWAS
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | P | 函数 | 基因 | 上/下距离 |
---|
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg05007375 | 14 | 92588364 | NDUFB1; CPSF2 | 7.8 e-5 | -0.215 | 0.025 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
REACTOME INTRONLESS PRE mrna的处理 | 14 | 6 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME处理限制包含前信使rna基因内区 | 140年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME运输细胞质成熟的成绩单 | 54 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME RNA聚合酶II转录 | 105年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME MRNA加工 | 161年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME信使rna剪接 | 111年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME封顶INTRONLESS PRE MRNA的处理 | 23 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME转录 | 210年 | 127年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME运输成熟的MRNA源自INTRONLESS成绩单 | 33 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME MRNA 3结束处理 | 35 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
在终止地区REACTOME乳沟的成绩单 | 44 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王LMO4 DN的目标 | 352年 | 225年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 | 1278年 | 748年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗德里格斯甲状腺癌分化不良 | 633年 | 376年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗德里格斯甲状腺未分化癌 | 722年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MARKEY RB1急性LOF DN | 228年 | 137年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
帕蒂尔肝癌 | 747年 | 453年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
INAMURA肺癌鳞状细胞癌亚型 | 14 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL CIS | 128年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHESLER大脑QTL独联体 | 75年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOLDRATH稳态扩散 | 171年 | 102年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日生发中心辅助T | 66年 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BYSTRYKH造血干细胞和大脑QTL CIS | 65年 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHESLER大脑最高的遗传方差 | 37 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃造血干细胞 | 254年 | 164年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马森受FOXP3刺激 | 1022年 | 619年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
YAUCH刺猬信号旁分泌 | 149年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王肿瘤侵袭性了 | 374年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BOYLAN多发性骨髓瘤C D | 139年 | 95年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PILON KLF1目标了 | 504年 | 321年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |