基因页面:DCLK3
总结吗?
GeneID | 85443年 |
象征 | DCLK3 |
同义词 | CLR | DCAMKL3 | DCDC3C | DCK3 |
描述 | doublecortin像激酶3 |
参考 | MIM: 613167|HGNC: HGNC: 19005|运用:ENSG00000163673|织女:OTTHUMG00000155805 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 3 p22.2 |
帕斯卡假定值 | 0.347 |
胎儿β | -0.368 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:GWAScat | 全基因组关联研究 | 这个数据集包含560个snp与精神分裂症有关。总共有486个基因映射到这些snp在50 kb。 | |
简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
简历:PGC128 | 全基因组关联研究 | 一个多阶段精神分裂症GWAS的36989例和113075控制。包括精神分裂症工作组的报告。128年独立协会跨越108位点 | |
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.006 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
简历:PGC128
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | P | 函数 | 基因 | 上/下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
rs75968099 | chr3 | 36858583 | TC | 3.386 e-12 | 基因间的 | DCLK3, TRANK1 | dist = 77231; dist = 9725 |
认为表
基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DCLK3 | chr3 | 36778993 | G | 一个 | NM_033403 | 。 | 沉默 | 精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005524 | ATP结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0004674 | 蛋白质的丝氨酸/苏氨酸激酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016740 | 转移酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006468 | 蛋白质磷酸化氨基酸 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
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TERAMOTO OPN集群目标1 | 13 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO和H3K9ME3肝癌 | 141年 | 75年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿塞维多甲基化在肝癌DN | 940年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PEDRIOLI MIR31目标 | 418年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO DN FGFR1在前列腺癌的目标模型 | 308年 | 187年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |