基因页面:EIF6
总结吗?
GeneID | 3692年 |
象征 | EIF6 |
同义词 | 出租车| EIF3A | ITGB4BP gcn | | b (2) eIF-6 | p27 (BBP) | p27BBP |
描述 | 真核翻译起始因子6 |
参考 | MIM: 602912|HGNC: HGNC: 6159|运用:ENSG00000242372|HPRD: 04221|织女:OTTHUMG00000032328 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 20日12 |
帕斯卡假定值 | 0.177 |
夏洛克假定值 | 0.497 |
胎儿β | 0.337 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PheWAS | Phenome-wide协会研究(PheWAS) | 157个snp与精神分裂症有关 | 1 |
网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.1714 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
简历:PheWAS
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | P | 函数 | 基因 | 上/下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
rs619865 | 20. | 33867697 | 零 | 1.752 | EIF6 | 零 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C3orf63 | 0.90 | 0.91 |
WDR44 | 0.90 | 0.91 |
IBTK | 0.88 | 0.90 |
HERC4 | 0.88 | 0.90 |
ZMYND11 | 0.87 | 0.89 |
EDEM3 | 0.87 | 0.89 |
MGEA5 | 0.87 | 0.88 |
MORC3 | 0.87 | 0.89 |
DNAJC10 | 0.87 | 0.89 |
RABEP1 | 0.87 | 0.89 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FXYD1 | -0.68 | -0.70 |
MT-CO2 | -0.68 | -0.72 |
AF347015.31 | -0.67 | -0.71 |
HIGD1B | -0.65 | -0.71 |
ENHO | -0.65 | -0.76 |
AF347015.21 | -0.65 | -0.67 |
AF347015.33 | -0.64 | -0.66 |
IFI27 | -0.64 | -0.68 |
AF347015.8 | -0.63 | -0.69 |
MT-CYB | -0.63 | -0.67 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003743 | 翻译起始因子的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 15231747|17353931 | |
去:0043022 | 核糖体绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006412 | 翻译 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0042256 | 成熟的核糖体的组装 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 助教 | 9374518 | |
去:0005638 | 核纤层蛋白丝 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ABCF1 | ABC27 | ABC50 | 磷酸腺苷磁带,sub-family F (GCN20),成员1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
ACAP3 | CENTB5 | KIAA1716 | ArfGAP与卷曲螺旋锚蛋白重复和PH值域3 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
ACTG1 | 法|代理| DFNA20 | DFNA26 | 肌动蛋白,γ1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
AKT1S1 | 叶| MGC2865 | PRAS40 | AKT1基质1(脯氨酸) | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
ALDH2 | ALDH-E2 | ALDHI | ALDM | MGC1806 | 醛脱氢酶2家(线粒体) | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
ARF6 | DKFZp564M0264 | ADP-ribosylation因子6 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
BCCIP | TOK-1 | TOK1 | BRCA2和CDKN1A相互作用的蛋白质 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
C1orf103 | FLJ11269 | RIF1 | rp11 - 96 k19.1 | 染色体1 103年开放阅读框 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
C4orf27 | FLJ20534 | FLJ33423 | FLJ42042 | 4号染色体开放阅读框27 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
CRELD1 | AVSD2 | CIRRIN | DKFZp566D213 | cysteine-rich与EGF-like域1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
EIF3B | EIF3-ETA | EIF3-P110 | EIF3-P116 | EIF3S9 | MGC104664 | MGC131875 | PRT1 | 真核翻译起始因子3 B亚基 | Co-purification | BioGRID | 15946946 |
EIF3C | EIF3S8 | FLJ78287 | MGC189744 | eIF3-p110 | 真核翻译起始因子3,亚基C | Co-purification | BioGRID | 15946946 |
EIF3J | EIF3S1 | eIF3-alpha | eIF3-p35 | 真核翻译起始因子3,亚基J | Co-purification | BioGRID | 15946946 |
ENOX1 | CNOX | FLJ10094 | PIG38 | bA64J21.1 | cCNOX | ecto-NOX disulfide-thiol换热器1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
FHL2 | AAG11 | DRAL | SLIM3 | 四个半LIM域2 | 亲和力Capture-Western 2台混合动力 |
BioGRID | 10906324 |
FIBP | FGFIBP | FIBP-1 | 纤维母细胞生长因子(酸性)细胞内结合蛋白 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
FUNDC2 | DC44 | FLJ33773 | HCBP6 | HCC3 | MGC131676 | MGC2495 | PD03104 | FUN14域包含2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
付家 | 切| FUS-CHOP | FUS1 | TLS | TLS /切| hnRNP-P2 | 融合(参与t(12、16)在恶性脂肪肉瘤) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
GIT1 | - - - - - - | G protein-coupled受体激酶相互作用ArfGAP 1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
GNB2L1 | Gnb2-rs1 | H12.3 | HLC-7 | PIG21 | RACK1 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2 1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 14654845 |
GNB2L1 | Gnb2-rs1 | H12.3 | HLC-7 | PIG21 | RACK1 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2 1 | eIF6与RACK1 | 绑定 | 14654845 |
GTPBP4 | CRFG | FLJ10686 | FLJ10690 | FLJ39774 | NGB | NOG1 | 三磷酸鸟苷结合蛋白4 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
HAS1 | 有 | 透明质酸合酶1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
HIP1 | ILWEQ | MGC126506 | 杭丁顿蛋白相互作用蛋白1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
ITGB4 | CD104 | 整合素β4 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9374518 |
KIAA1377 | - - - - - - | KIAA1377 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
LOC387753 | - - - - - - | 类似于60年代L21核糖体蛋白质 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
MRPS31 | IMOGN38 | MRP-S31 | S31mt | 线粒体核糖体蛋白S31 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
NPEPPS | PSA MP100 | | 氨肽酶嘌呤霉素敏感 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
燕麦 | DKFZp781A11155 | HOGA | 鸟氨酸转氨酶(旋转萎缩) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
OFD1 | 71 - 7 - | CXorf5 | MGC117039 | MGC117040 | SGBS2 | oral-facial-digital综合征1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
PAICS | 现ADE2 | ADE2H1 | | DKFZp781N1372 | MGC1343 | MGC5024 |《国家 | phosphoribosylaminoimidazole羧化酶,phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide合成酶 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
PDHA1 | PDHA | PDHCE1A | PHE1A | 丙酮酸脱氢酶(lipoamide)α1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
POLA2 | FLJ21662 | FLJ37250 | DNA聚合酶(导演)、α- 2 (70 kd亚基) | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
PRKCB | MGC41878 | PKC-beta | PKCB | PRKCB1 | PRKCB2 | 蛋白激酶C、β | - - - - - - | HPRD | 14654845 |
PSME1 | IFI5111 | MGC8628 | PA28A | PA28alpha | REGalpha | 蛋白酶体(prosome macropain)激活单元1 (PA28α) | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
RGS10 | - - - - - - | 监管机构的蛋白信号10 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
RPL3 | MGC104284 | TARBP-B | 核糖体蛋白L3 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
RPL34 | MGC111005 | 核糖体蛋白吧 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
RPL6 | SHUJUN-2 | TAXREB107 | TXREB1 | 核糖体蛋白16种 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
RRP15 | cgi - 115 | KIAA0507 | MGC22291 | 核糖体RNA加工15同族体(酵母) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
SEPT3 | MGC133218 | SEP3 | bK250D10.3 | septin 3 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
SORBS1 | 帽| DKFZp451C066 | DKFZp586P1422 | FLAF2 | FLJ12406 | KIAA1296 | R85FL | SH3D5 | SH3P12 | SORB1 | 山梨糖和SH3域包含1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
UPF3B | HUPF3B | MRXS14 | RENT3B | UPF3X | UPF3调节器的废话成绩单同族体B(酵母) | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
USP33 | KIAA1097 | MGC16868 | VDU1 | 泛素特定肽酶33 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
WFS1 | DFNA14 | DFNA38 | DFNA6 | DIDMOAD |公司| WFS | WOLFRAMIN | Wolfram综合征1 (wolframin) | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
纱线 | CMTDIC | TYRRS |年|走 | tyrosyl-tRNA合成酶 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
BIOCARTA EIF通路 | 16 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MULLIGHAN NPM1突变签名1 DN | 126年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MULLIGHAN NPM1突变签名2 DN | 77年 | 46 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MULLIGHAN NPM1签名3 DN | 162年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ENK紫外线反应角化细胞 | 530年 | 342年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BERENJENO通过RHOA转换 | 536年 | 340年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
洛佩兹MBD的目标 | 957年 | 597年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
鲜明的前额叶皮层22 q11删除DN | 517年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NIKOLSKY乳腺癌20 q11扩增子 | 31日 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
谢泼德粉碎和燃烧突变 | 197年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MOREIRA应对TSA | 28 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃造血作用中间祖 | 149年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BANDRES应对CARMUSTIN管理48小时DN | 161年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
年级结肠癌和直肠癌 | 285年 | 167年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
黄胚胎干细胞核心 | 335年 | 193年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金所有障碍少突细胞数量。柯尔 | 756年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金双相情感障碍少突细胞密度相关系数 | 682年 | 440年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金所有障碍持续时间CORR DN | 146年 | 90年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG 8 d | 658年 | 397年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |