基因页面:FAM13A
总结吗?
| GeneID | 10144年 |
| 象征 | FAM13A |
| 同义词 | ARHGAP48 | FAM13A1 |
| 描述 | 有序列相似性13个成员的家庭 |
| 参考 | MIM: 613299|HGNC: HGNC: 19367|运用:ENSG00000138640|HPRD: 10944|织女:OTTHUMG00000161006 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 4 q22.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.309 |
| 夏洛克假定值 | 0.657 |
| 胎儿β | 1.462 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWAScat | 全基因组关联研究 | 这个数据集包含560个snp与精神分裂症有关。总共有486个基因映射到这些snp在50 kb。 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 简历:PheWAS | Phenome-wide协会研究(PheWAS) | 157个snp与精神分裂症有关 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
简历:PheWAS
简历:PheWAS| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | P | 函数 | 基因 | 上/下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7671167 | 4 | 89883979 | 零 | 0.6768 | FAM13A | 零 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AGAP2 | 0.85 | 0.86 |
| JPH3 | 0.85 | 0.87 |
| REXO1 | 0.84 | 0.85 |
| C19orf26 | 0.83 | 0.87 |
| CSNK1G2 | 0.83 | 0.86 |
| JPH4 | 0.82 | 0.82 |
| 启动 | 0.82 | 0.81 |
| SPTBN4 | 0.81 | 0.85 |
| DVL1 | 0.81 | 0.87 |
| KIFC2 | 0.81 | 0.84 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GNG11 | -0.49 | -0.49 |
| AF347015.21 | -0.48 | -0.36 |
| AL139819.3 | -0.46 | -0.45 |
| MYL12A | -0.46 | -0.50 |
| C1orf54 | -0.45 | -0.42 |
| AF347015.31 | -0.44 | -0.34 |
| AL138743.2 | -0.42 | -0.38 |
| CLEC2B | -0.42 | -0.39 |
| MT-CO2 | -0.40 | -0.31 |
| AP002478.3 | -0.40 | -0.35 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| ρgtpase REACTOME信号 | 113年 | 81年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 父母MTOR信号了 | 567年 | 375年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 中村肿瘤区周边与中央DN | 634年 | 384年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 刘SOX4 DN的目标 | 309年 | 191年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAZDA钻石BLACKFAN贫血红细胞DN | 493年 | 298年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DEURIG T细胞PROLYMPHOCYTIC白血病 | 368年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN BASAKI YBX1目标 | 384年 | 230年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 奥斯瓦尔德在胶原凝胶DN造血干细胞 | 275年 | 168年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 维奇缺氧了 | 171年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 维奇DMOG缺氧的 | 130年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 维奇HIF1A DN的目标 | 91年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 维奇HIF1A和HIF2A目标DN | 104年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗德里格斯甲状腺癌分化不良DN | 805年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗德里格斯甲状腺未分化癌DN | 537年 | 339年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOZGIT ESR1目标了 | 149年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| EBAUER目标PAX3 FOXO1融合起来 | 207年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布伊泰尔特说光动力治疗压力 | 811年 | 508年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展48小时DN | 428年 | 306年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MENSE缺氧了 | 98年 | 71年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染48小时血巨细胞病毒 | 180年 | 125年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CREIGHTON内分泌治疗抵抗3 | 720年 | 440年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LEIN脑桥标记 | 89年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MASSARWEH他莫昔芬耐了 | 578年 | 341年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MITSIADES APLIDIN反应 | 439年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOQUEST干细胞培养与新鲜 | 425年 | 298年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 射线能够以ERBB2 CDC25A DN | 159年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOYLAN多发性骨髓瘤C | 47 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHEDDEN肺癌好生存A4 | 196年 | 124年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗马胰岛素的目标肌肉DN | 204年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOYAULT肝癌子类G12 DN | 15 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HOSHIDA肝癌晚期复发 | 62年 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP | 718年 | 401年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大与H3K4ME3 ICP | 445年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒30分钟 | 56 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 若林史江脂肪生成PPARG RXRA 8 d | 882年 | 506年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 若林史江脂肪生成PPARG RXRA绑定与H4K20ME1马克 | 145年 | 82年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王MLL目标 | 289年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LIM乳腺腔的成熟的DN | 99年 | 74年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |