概括
基因 348751
象征 FTCDNL1
同义词
描述 形式转移酶环肽酶N末端类似
参考 MIM:614308|HGNC:HGNC:48661|ENSEMBL:ENSG00000226124|Vega:Otthumg00000154481
基因类型 ncRNA
地图位置 2q33.1
Pascal P值 1.763E-7
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
海马
下丘脑
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历:RIPKE_2013 全基因组协会研究 多阶段GWA,瑞典人口和PGC2。24个领先的SNP

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6759018 2 200620763 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 6.019e-12 0 95133 gtex_brain_ba24
RS4530349 2 200621420 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 2.569E-10 0 94476 gtex_brain_ba24
RS5837706 2 200624970 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 5.463e-12 0 90926 gtex_brain_ba24
RS2346585 2 200625156 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 2.569E-10 0 90740 gtex_brain_ba24
RS2346586 2 200625581 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 5.428e-12 0 90315 gtex_brain_ba24
RS11687699 2 200626678 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 5.011e-12 0 89218 gtex_brain_ba24
RS13008446 2 200628500 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 2.899e-12 0 87396 gtex_brain_ba24
RS11692783 2 200630389 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 1.816E-8 0 85507 gtex_brain_ba24
RS11677090 2 200641554 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 5.637E-7 0 74342 gtex_brain_ba24
RS6752100 2 200650760 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 1.506E-6 0 65136 gtex_brain_ba24
RS1357582 2 200578867 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 1.201E-6 0 137029 gtex_brain_putamen_basal
RS4673435 2 200579502 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 1.234E-6 0 136394 gtex_brain_putamen_basal
RS4500928 2 200582952 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 1.397E-8 0 132944 gtex_brain_putamen_basal
RS13030515 2 200583975 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 3.844e-8 0 131921 gtex_brain_putamen_basal
RS75025095 2 200586051 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 2.881E-7 0 129845 gtex_brain_putamen_basal
RS77470177 2 200586096 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 2.881E-7 0 129800 gtex_brain_putamen_basal
RS60768713 2 200586170 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 2.875E-7 0 129726 gtex_brain_putamen_basal
RS59401112 2 200587560 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 2.875E-7 0 128336 gtex_brain_putamen_basal
RS59734838 2 200587588 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 2.875E-7 0 128308 gtex_brain_putamen_basal
RS10181327 2 200589667 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 5.701E-8 0 126229 gtex_brain_putamen_basal
RS12477383 2 200590047 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 1.415E-8 0 125849 gtex_brain_putamen_basal
RS6719793 2 200592140 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 2.875E-7 0 123756 gtex_brain_putamen_basal
RS12052622 2 200592510 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 2.875E-7 0 123386 gtex_brain_putamen_basal
RS1523819 2 200592864 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 2.875E-7 0 123032 gtex_brain_putamen_basal
RS7576880 2 200597218 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 1.418E-6 0 118678 gtex_brain_putamen_basal
RS4673449 2 200597617 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 7.841E-7 0 118279 gtex_brain_putamen_basal
RS1996948 2 200598114 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 1.74E-8 0 117782 gtex_brain_putamen_basal
RS1916721 2 200601021 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 1.413E-6 0 114875 gtex_brain_putamen_basal
RS6435032 2 200602642 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 1.412E-6 0 113254 gtex_brain_putamen_basal
RS4672548 2 200603517 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 2.195E-8 0 112379 gtex_brain_putamen_basal
RS11695675 2 200607333 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 4.716E-10 0 108563 gtex_brain_putamen_basal
RS6759018 2 200620763 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 3.722e-16 0 95133 gtex_brain_putamen_basal
RS4530349 2 200621420 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 3.842e-13 0 94476 gtex_brain_putamen_basal
RS5837706 2 200624970 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 4.096E-16 0 90926 gtex_brain_putamen_basal
RS2346585 2 200625156 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 3.968e-13 0 90740 gtex_brain_putamen_basal
RS2346586 2 200625581 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 4.076E-16 0 90315 gtex_brain_putamen_basal
RS11687699 2 200626678 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 3.232E-16 0 89218 gtex_brain_putamen_basal
RS13008446 2 200628500 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 1.097E-16 0 87396 gtex_brain_putamen_basal
RS11692783 2 200630389 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 1.993E-10 0 85507 gtex_brain_putamen_basal
RS1523815 2 200632835 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 3.236E-10 0 83061 gtex_brain_putamen_basal
RS1523816 2 200632991 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 4.591E-10 0 82905 gtex_brain_putamen_basal
RS7556874 2 200640997 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 2.18e-6 0 74899 gtex_brain_putamen_basal
RS6711594 2 200655136 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 1.21E-6 0 60760 gtex_brain_putamen_basal
RS6710237 2 200658051 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 4.449E-6 0 57845 gtex_brain_putamen_basal
RS12693901 2 200663361 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 2.54E-6 0 52535 gtex_brain_putamen_basal
RS4353632 2 200663487 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 3.129E-7 0 52409 gtex_brain_putamen_basal
RS10931878 2 200666787 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 9.821E-7 0 49109 gtex_brain_putamen_basal
RS4519507 2 200669520 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 1.615E-6 0 46376 gtex_brain_putamen_basal
RS12693902 2 200670094 FTCDNL1 ENSG00000226124.2 1.335E-8 0 45802 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因