基因页：fut9
概括？
| 基因 | 10690 |
| 象征 | fut9 |
| 同义词 | fuc-tix |
| 描述 | 岩藻糖基转移酶9（α（1,3）岩藻糖基转移酶） |
| 参考 | MIM：606865|HGNC：HGNC：4020|ENSEMBL：ENSG00000172461|HPRD：06036|Vega：Otthumg0000000015236 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6Q16 |
| Pascal P值 | 0.001 |
| 胎儿β | 0.463 |
| 主持人 | 小脑半球 小脑 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历：PGC128
简历：PGC128| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS117074560 | CHR6 | 96459651 | TC | 1.661E-8 | 基因间 | Manea，FUT9 | dist = 402323; dist = 4194 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FAM38A | 0.78 | 0.75 |
| 奥普拉 | 0.78 | 0.78 |
| kif1c | 0.75 | 0.73 |
| GPT | 0.75 | 0.66 |
| GATA2 | 0.74 | 0.69 |
| Trim56 | 0.73 | 0.76 |
| Caskin2 | 0.73 | 0.75 |
| RGL3 | 0.73 | 0.65 |
| TBX2 | 0.73 | 0.70 |
| FGFRL1 | 0.73 | 0.76 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TAF9 | -0.64 | -0.63 |
| ACTR10 | -0.62 | -0.57 |
| ube2d2 | -0.61 | -0.55 |
| VPS29 | -0.61 | -0.62 |
| 法尔斯布 | -0.61 | -0.57 |
| GGPS1 | -0.61 | -0.56 |
| FAM92A1 | -0.61 | -0.59 |
| PPP2R3C | -0.61 | -0.65 |
| spata7 | -0.60 | -0.57 |
| mtx2 | -0.60 | -0.53 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO：0016757 | 转移酶活性，转移糖基团 | IEA | - | |
| 去：0046920 | α（1,3） - 葡萄糖基转移酶活性 | 塔斯 | 11698403 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006486 | 蛋白氨基酸糖基化 | 塔斯 | 11698403 | |
| 去：0005975 | 碳水化合物代谢过程 | 塔斯 | 10386598 | |
| GO：0042355 | L-核分解代谢过程 | nas | 11698403 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005794 | 高尔基体 | 塔斯 | 11698403 | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KeGG糖果果脂生物合成乳酸和新乳糖系列 | 26 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg糖果果脂生物合成球序列 | 14 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee神经Crest干细胞DN | 118 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nagashima NRG1信号传导DN | 58 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 布朗HCMV感染48小时 | 180 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染6小时 | 71 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性5 | 482 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张GATA6靶向 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wagner Apo2敏感性 | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染1小时 | 61 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verhaak胶质母细胞瘤神经 | 129 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| figueroa aml甲基化簇6 | 140 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 | 308 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-130/301 | 9247 | 9254 | 1A，M8 | HSA-MIR-130A脑 | cagugcaauguaaaaggggau |
| HSA-MIR-301 | cagugcaauaugucaaagc | ||||
| HSA-MIR-130b脑 | Cagugcaaugaagggauggau | ||||
| HSA-MIR-454-3P | uagugcaauauugcuuauaggguuu | ||||
| mir-135 | 10928 | 10934 | M8 | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
| HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
| mir-182 | 9303 | 9309 | 1a | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
| mir-183 | 8838 | 8844 | 1a | HSA-MIR-183 | uauggcacugguagaauucacug |
| mir-19 | 9246 | 9252 | M8 | HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga |
| HSA-MIR-19B | ugugcaaauccaugcaaaacuga | ||||
| mir-199 | 11275 | 11281 | 1a | HSA-MIR-199A | cccaguucagacuaccuguuc |
| HSA-MIR-199B | cccaguguuuagacuaucuuc | ||||
| mir-218 | 9433 | 9439 | M8 | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
| mir-22 | 10905 | 10912 | 1A，M8 | HSA-MIR-22脑 | Aagcugccaguugaagaacugu |
| mir-23 | 3131 | 3138 | 1A，M8 | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
| HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
| mir-26 | 9529 | 9535 | 1a | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
| HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||
| mir-323 | 3131 | 3137 | 1a | HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu |
| mir-34/449 | 9709 | 9716 | 1A，M8 | HSA-MIR-34A脑 | uggcaguguuaguguguuuu |
| HSA-MIR-34C | Aggcaguguaguagcugauugc | ||||
| HSA-MIR-449 | uggcaguguauuguagcuggu | ||||
| HSA-MIR-449B | Aggcaguguauuguuagcuggc | ||||
| HSA-MIR-34A脑 | uggcaguguuaguguguuuu | ||||
| HSA-MIR-34C | Aggcaguguaguagcugauugc | ||||
| HSA-MIR-449 | uggcaguguauuguagcuggu | ||||
| HSA-MIR-449B | Aggcaguguauuguuagcuggc | ||||
| HSA-MIR-34A脑 | uggcaguguuaguguguuuu | ||||
| HSA-MIR-34C | Aggcaguguaguagcugauugc | ||||
| HSA-MIR-449 | uggcaguguauuguagcuggu | ||||
| HSA-MIR-449B | Aggcaguguauuguuagcuggc | ||||
| mir-493-5p | 9309 | 9315 | M8 | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |
| mir-96 | 9303 | 9309 | 1a | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |