基因页：gramd1b

概括？
基因 57476
象征 gramd1b
同义词 -
描述 含1B的革兰氏域
参考 HGNC：HGNC：29214|ENSEMBL：ENSG00000023171|Vega：Otthumg00000166004
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q24.1
Pascal P值 0.006
胎儿β 0.661
DMG 1（＃研究）
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
简历：PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历：PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS77502336 Chr11 123394636 CG 2.008e-9 基因间 mir4493，gramd1b dist = 142416; dist = 1708

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG10734246 11 123478349 gramd1b 1.179E-4 0.491 0.029 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
vash2 0.96 0.88
FAM117B 0.96 0.89
KDM5B 0.95 0.89
ZKSCAN2 0.95 0.88
PBRM1 0.95 0.89
DCX 0.95 0.92
CEP170 0.94 0.89
PRRC1 0.94 0.87
BRD3 0.94 0.89
MBTD1 0.94 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
LHPP -0.67 -0.66
C5orf53 -0.67 -0.79
FBXO2 -0.67 -0.71
HLA-F -0.67 -0.82
aldoc -0.66 -0.76
AIFM3 -0.66 -0.80
pth1r -0.65 -0.76
TNFSF12 -0.65 -0.72
SLC16A11 -0.65 -0.69
LDHD -0.65 -0.72

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应480 HELA 164 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠与直肠癌DN 56 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D DN 252 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集15 31 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON FOXP3目标DN 54 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 UP 140 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向 279 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因