基因页：hhat
概括？
| 基因 | 55733 |
| 象征 | hhat |
| 同义词 | mart2 | ski1 | skn |
| 描述 | 刺猬酰基转移酶 |
| 参考 | MIM：605743|HGNC：HGNC：18270|Ensembl：ENSG00000054392|HPRD：12041|Vega：Otthumg0000000036447 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q32 |
| 胎儿β | -1.271 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG21147040 | 1 | 210655903 | hhat | 1.479E-4 | -0.639 | 0.032 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17029291 | CHR3 | 32402138 | hhat | 55733 | 7.944e-6 | 反式 | ||
| RS16958358 | CHR17 | 55502410 | hhat | 55733 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| mpp7 | 0.60 | 0.62 |
| EPB41L4B | 0.59 | 0.56 |
| diras2 | 0.58 | 0.59 |
| Plekha1 | 0.58 | 0.52 |
| Mkx | 0.58 | 0.52 |
| nipal2 | 0.57 | 0.52 |
| NLK | 0.57 | 0.59 |
| TMEM155 | 0.57 | 0.55 |
| FGFR1OP2 | 0.56 | 0.55 |
| RIMS2 | 0.56 | 0.53 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| EFEMP2 | -0.34 | -0.39 |
| SEMA4B | -0.31 | -0.30 |
| metrnl | -0.29 | -0.38 |
| pde9a | -0.29 | -0.32 |
| WDR86 | -0.29 | -0.31 |
| emid1 | -0.29 | -0.31 |
| AC006028.3 | -0.28 | -0.31 |
| cdc42ep4 | -0.28 | -0.30 |
| sigirr | -0.28 | -0.33 |
| SMTN | -0.28 | -0.32 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID刺猬2 Pathway | 22 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇3 DN | 229 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和血清剥夺的反应 | 211 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 农民乳腺癌基础与仙女 | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标 | 212 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vantveer乳腺癌ESR1 UP | 167 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP，含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Keshelava多种耐药性 | 88 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma ns | 162 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |