基因页：HLA-DRA

Summary？
基因ID 3122
象征 HLA-DRA
同义词 HLA-DRA1 | MLRW
描述 主要的组织相容性复合物，II类，Alpha博士
参考 MIM：142860|HGNC：HGNC：4947|Ensembl：ENSG00000204287|HPRD：00833|Vega:OTTHUMG00000031269
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p21.3
Pascal P值 1E-12
Sherlock P值 0.066
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历：RIPKE_2013 全基因组协会研究 Multi-stage GWAS, Sweden population and PGC2. 24 leading SNPs
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.033
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11216720 Chr11 117909100 HLA-DRA 3122 4.255e-7 反式
RS12223165 Chr11 117910016 HLA-DRA 3122 4.255e-7 反式
RS11216730 Chr11 117918701 HLA-DRA 3122 2.996E-8 反式
rs8012787 CHR14 36085745 HLA-DRA 3122 0.14 反式
SNP_A-2138420 0 HLA-DRA 3122 0.14 反式
RS11623645 CHR14 36195311 HLA-DRA 3122 0.14 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CD59 0.78 0.76
TMBIM1 0.77 0.80
赫尔克6 0.75 0.76
CTBS 0.75 0.72
希巴德 0.74 0.76
CSRP1 0.74 0.78
Mro 0.74 0.81
me1 0.74 0.77
gramd3 0.73 0.80
HSPB8 0.73 0.79
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA1949 -0.59 -0.57
nkiras2 -0.58 -0.55
ZNF311 -0.58 -0.61
tubb2b -0.58 -0.59
ZNF821 -0.58 -0.58
SH2B2 -0.58 -0.67
MARCKSL1 -0.57 -0.59
PKN1 -0.57 -0.60
Gmip -0.57 -0.56
mpp3 -0.57 -0.55

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0032395 MHC class II receptor activity nas 6304715|6812963
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0002504 通过MHC II类的肽或多糖抗原的抗原加工和呈递 IEA -
去：0006955 免疫反应 IEA -
去：0006955 免疫反应 nas 6304715|6812963
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005764 溶酶体 艾达 8890155
GO:0016020 膜 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去：0005886 质膜 EXP 11048639|11827988|15489916
|17652306
去：0005886 质膜 艾达 8890155
去：0005887 质膜的积分 nas 6304715|6812963
GO：0042613 MHC II类蛋白质复合物 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
kegg细胞粘附分子凸轮 134 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG抗原处理和演示 89 65 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG造血细胞谱系 88 60 All SZGR 2.0 genes in this pathway
IGA生产的KEGG肠道免疫网络 48 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG I型糖尿病 44 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kegg Leishmania感染 72 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kegg哮喘 30 25 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG自身免疫性甲状腺疾病 53 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kegg系统性狼疮红斑 140 100 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG同种异体拒绝 38 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG移植与宿主疾病 42 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG病毒心肌炎 73 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta CSK途径 24 20 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta Asbcell途径 12 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta Blymphocyte途径 11 8 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta fordam途径 29 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta IL5途径 10 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta TCRA途径 13 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta Th1th2途径 19 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta CTLA4途径 21 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID TCR途径 66 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID IL12 2 Pathway 63 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID CXCR4途径 102 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID IL12 STAT4途径 33 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schuetz乳腺癌导管侵入性 351 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
thum收缩性心力衰竭 423 283 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bidus转移DN 161 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LUI甲状腺癌簇4 16 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gruetzmann胰腺癌 358 245 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络 1442 892 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath循环基因 648 385 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH造血干细胞QTL顺式 128 77 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HBV感染的Wieland 101 66 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Iizuka肝癌早期复发 11 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BROWN MYELOID CELL DEVELOPMENT DN 129 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NPM1定位DN的Alcalay AML 184 132 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hendricks Smarca4靶向DN 53 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
麦克拉克兰牙齿龋齿DN 245 144 All SZGR 2.0 genes in this pathway
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 All SZGR 2.0 genes in this pathway
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 All SZGR 2.0 genes in this pathway
海勒被甲基化沉默 282 183 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Heller HDAC靶向DN 292 189 All SZGR 2.0 genes in this pathway
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝癌 973 570 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 All SZGR 2.0 genes in this pathway
萧述三乳腺癌等正常 476 285 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gaurnier PSMD4目标 73 55 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞DN 216 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
西部肾上腺皮质癌与腺瘤DN 24 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bredemeyer抹布信令不是通过ATM DN 57 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BEIER GLIOMA STEM CELL DN 66 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mootha PGC 420 269 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ichiba移植与宿主疾病D7 UP 107 67 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ICHIBA GRAFT VERSUS HOST DISEASE 35D DN 49 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜肺癌克拉斯 491 316 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hsiao家政基因 389 245 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Valk AML群集6 33 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Budhu肝癌转移 10 7 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yagi AML带8 21易位 368 247 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sakai慢性肝炎与肝癌 83 63 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NAKAYAMA SOFT TISSUE TUMORS PCA1 UP 76 46 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WHITFIELD C细胞YCLE G2 182 102 All SZGR 2.0 genes in this pathway
gregory合成致死与伊马替尼 145 83 All SZGR 2.0 genes in this pathway
APC和MBD2的Phesse目标 20 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标3 430 288 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim Glis2靶向 84 61 All SZGR 2.0 genes in this pathway