基因页：IGSF9B
概括？
| 基因 | 22997 |
| 象征 | IGSF9B |
| 同义词 | - |
| 描述 | 免疫球蛋白超家族成员9B |
| 参考 | MIM：613773|HGNC：HGNC：32326|ENSEMBL：ENSG00000080854|Vega：Otthumg00000167124 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11Q25 |
| Pascal P值 | 1E-12 |
| Sherlock P值 | 0.719 |
| 胎儿β | -0.496 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 3 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 3 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历：PGC128
简历：PGC128| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS75059851 | Chr11 | 133822569 | Ag | 1.232e-11 | 内含子 | IGSF9B |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG03392386 | 11 | 133800800 | IGSF9B | 7.63e-5 | 0.511 | 0.025 | DMG：Wockner_2014 |
| CG18057887 | 11 | 133800913 | IGSF9B | 2.193E-4 | 0.396 | 0.036 | DMG：Wockner_2014 |
| CG18162528 | 11 | 133826660 | IGSF9B | 1.31E-10 | -0.021 | 4.86e-7 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS9435589 | CHR1 | 234872443 | IGSF9B | 22997 | 0.11 | 反式 | ||
| RS6753473 | CHR2 | 26526418 | IGSF9B | 22997 | 1.7E-4 | 反式 | ||
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | IGSF9B | 22997 | 9.27e-12 | 反式 | ||
| RS7584986 | CHR2 | 184111432 | IGSF9B | 22997 | 0.05 | 反式 | ||
| RS6807632 | CHR3 | 111395567 | IGSF9B | 22997 | 0.19 | 反式 | ||
| RS10474151 | CHR5 | 84286402 | IGSF9B | 22997 | 0.18 | 反式 | ||
| RS1368303 | CHR5 | 147672388 | IGSF9B | 22997 | 0.03 | 反式 | ||
| RS17166659 | CHR7 | 132342143 | IGSF9B | 22997 | 0.09 | 反式 | ||
| RS1020772 | Chr9 | 76532511 | IGSF9B | 22997 | 0.17 | 反式 | ||
| RS3025425 | Chr9 | 136523165 | IGSF9B | 22997 | 0.1 | 反式 | ||
| RS10834670 | Chr11 | 25404015 | IGSF9B | 22997 | 0.15 | 反式 | ||
| RS10834671 | Chr11 | 25404269 | IGSF9B | 22997 | 0.03 | 反式 | ||
| RS1526959 | CHR12 | 79753789 | IGSF9B | 22997 | 0.11 | 反式 | ||
| RS11066476 | CHR12 | 113465366 | IGSF9B | 22997 | 0.18 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | IGSF9B | 22997 | 1.021E-9 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TPPP | 0.93 | 0.87 |
| sirpa | 0.92 | 0.91 |
| Pacsin1 | 0.92 | 0.88 |
| 9月8日 | 0.91 | 0.92 |
| Stat6 | 0.90 | 0.87 |
| mast3 | 0.90 | 0.82 |
| PCDH9 | 0.89 | 0.78 |
| CAMK2A | 0.89 | 0.85 |
| susd5 | 0.89 | 0.89 |
| Synpo | 0.89 | 0.87 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Bcl7c | -0.62 | -0.74 |
| C9orf46 | -0.59 | -0.71 |
| tubb2b | -0.58 | -0.61 |
| traf4 | -0.58 | -0.67 |
| RPL18 | -0.57 | -0.77 |
| rps19p3 | -0.57 | -0.79 |
| RPS8 | -0.57 | -0.74 |
| Dynlt1 | -0.57 | -0.75 |
| KIAA1949 | -0.57 | -0.50 |
| RPL32 | -0.56 | -0.72 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |