基因页面:IMMP2L
总结吗?
GeneID | 83943年 |
象征 | IMMP2L |
同义词 | IMMP2L-IT1 | IMP2 | IMP2-LIKE |
描述 | 内线粒体膜肽酶亚基2 |
参考 | MIM: 605977|HGNC: HGNC: 14598|运用:ENSG00000184903|HPRD: 07297|织女:OTTHUMG00000155023 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 7问 |
帕斯卡假定值 | 3.587 e - |
夏洛克假定值 | 0.626 |
胎儿β | -0.17 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:GWAScat | 全基因组关联研究 | 这个数据集包含560个snp与精神分裂症有关。总共有486个基因映射到这些snp在50 kb。 | |
简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
简历:PGC128 | 全基因组关联研究 | 一个多阶段精神分裂症GWAS的36989例和113075控制。包括精神分裂症工作组的报告。128年独立协会跨越108位点 | |
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
简历:PheWAS | Phenome-wide协会研究(PheWAS) | 157个snp与精神分裂症有关 | 2 |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
简历:PGC128
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | P | 函数 | 基因 | 上/下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
rs13240464 | chr7 | 110898915 | TC | 6.162 e-13 | intronic | IMMP2L | |
rs211829 | chr7 | 110048893 | TC | 5.471 e - | 基因间的 | EIF3IP1, IMMP2L | dist = 448623; dist = 254213 |
简历:PheWAS
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | P | 函数 | 基因 | 上/下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
rs12531640 | 7 | 110479535 | 零 | 1.624 | IMMP2L | 零 | |
rs10279573 | 7 | 110467221 | 零 | 1.584 | IMMP2L | 零 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008236 | serine-type肽酶的活动 | 国际能源机构 | 谷氨酸(术语层面:6) | - - - - - - |
去:0008233 | 肽酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解作用 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006627 | 在导入线粒体蛋白质加工 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005739 | 线粒体 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0042720 | 线粒体内膜肽酶复杂 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG蛋白出口 | 24 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SHETH肝癌VS TXNIP PAM4损失 | 261年 | 153年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NUYTTEN NIPP1的目标了 | 769年 | 437年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
江缺氧正常 | 311年 | 205年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马丁内斯应对TRABECTEDIN DN | 271年 | 175年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
瑞士POSTRADIATION肿瘤逃避DN | 373年 | 196年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马丁内斯RB1 DN的目标 | 543年 | 317年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马丁内斯TP53的目标了 | 602年 | 364年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马丁内斯RB1和TP53的目标 | 601年 | 369年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MATZUK排卵期前的滤泡 | 10 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PURBEY CTBP1没有SATB1的目标 | 344年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |