概括
基因 3658
象征 IREB2
同义词 ACO3 | IRP2 | IRP2AD
描述 铁反应元件结合蛋白2
参考 MIM:147582|HGNC:HGNC:6115|ENSEMBL:ENSG00000136381|HPRD:08858|Vega:Otthumg00000143861
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q25.1
Pascal P值 1.749E-7
胎儿β 1.419
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历:Phewas 全球整个关联研究(PHEWAS) 157个与精神分裂症相关的SNP 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:Phewas

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS13180 15 78789488 无效的 1.499 IREB2 无效的

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7370564 0 IREB2 3658 0.05 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DOCK2 0.69 0.59
ITGB2 0.69 0.62
CD4 0.66 0.64
def6 0.65 0.59
WDFY4 0.64 0.60
PTPN6 0.63 0.57
apbb1ip 0.63 0.56
CSF1R 0.63 0.60
CSF3R 0.63 0.54
BIN2 0.62 0.61
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C8orf59 -0.31 -0.34
AC087071.1 -0.30 -0.33
NDUFAF2 -0.29 -0.36
RPL31 -0.28 -0.38
PFDN5 -0.27 -0.35
PFDN4 -0.27 -0.35
ST20 -0.27 -0.34
Commd3 -0.26 -0.28
Znf32 -0.26 -0.32
RPS7 -0.26 -0.34

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID MYC活动途径 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOOI ST7靶向DN 123 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌DN 406 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
田中甲基化食管癌中的甲基化 103 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TACI DN的moreaux b淋巴细胞成熟 73 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TACI DN的Moreaux多发性骨髓瘤 172 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染20小时 240 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成12 36 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向DN 314 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3 97 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stearman肺癌早期与晚期 125 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fujii YBX1靶向DN 202 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAE BRCA1靶向DN 32 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gabriely miR21靶标 289 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因