基因页:IREB2
概括?
基因 | 3658 |
象征 | IREB2 |
同义词 | ACO3 | IRP2 | IRP2AD |
描述 | 铁反应元件结合蛋白2 |
参考 | MIM:147582|HGNC:HGNC:6115|ENSEMBL:ENSG00000136381|HPRD:08858|Vega:Otthumg00000143861 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 15Q25.1 |
Pascal P值 | 1.749E-7 |
胎儿β | 1.419 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
简历:Phewas | 全球整个关联研究(PHEWAS) | 157个与精神分裂症相关的SNP | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:Phewas
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS13180 | 15 | 78789488 | 无效的 | 1.499 | IREB2 | 无效的 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7370564 | 0 | IREB2 | 3658 | 0.05 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
DOCK2 | 0.69 | 0.59 |
ITGB2 | 0.69 | 0.62 |
CD4 | 0.66 | 0.64 |
def6 | 0.65 | 0.59 |
WDFY4 | 0.64 | 0.60 |
PTPN6 | 0.63 | 0.57 |
apbb1ip | 0.63 | 0.56 |
CSF1R | 0.63 | 0.60 |
CSF3R | 0.63 | 0.54 |
BIN2 | 0.62 | 0.61 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C8orf59 | -0.31 | -0.34 |
AC087071.1 | -0.30 | -0.33 |
NDUFAF2 | -0.29 | -0.36 |
RPL31 | -0.28 | -0.38 |
PFDN5 | -0.27 | -0.35 |
PFDN4 | -0.27 | -0.35 |
ST20 | -0.27 | -0.34 |
Commd3 | -0.26 | -0.28 |
Znf32 | -0.26 | -0.32 |
RPS7 | -0.26 | -0.34 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID MYC活动途径 | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOOI ST7靶向DN | 123 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
田中甲基化食管癌中的甲基化 | 103 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TACI DN的moreaux b淋巴细胞成熟 | 73 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TACI DN的Moreaux多发性骨髓瘤 | 172 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染20小时 | 240 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 | 314 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成12 | 36 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27me3 | 97 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stearman肺癌早期与晚期 | 125 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fujii YBX1靶向DN | 202 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BAE BRCA1靶向DN | 32 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gabriely miR21靶标 | 289 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |