基因页:LINC01470
概括?
基因 | 101927134 |
象征 | LINC01470 |
同义词 | - |
描述 | 长基因间非蛋白质编码RNA 1470 |
参考 | HGNC:HGNC:51105|ENSEMBL:ENSG00000249484| |
基因类型 | ncRNA |
地图位置 | 5q33.1 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
LK:是的 | 全基因组协会研究 | 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV:RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:PGC128
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS111294930 | CHR5 | 152177121 | Ag | 1.312E-9 | ncrna_intronic | LINC01470 | |
RS2973155 | CHR5 | 152608619 | TC | 1.016E-9 | 基因间 | Linc01470,Gria1 | dist = 256710; dist = 261465 |
RS79212538 | CHR5 | 151993104 | TG | 3.843e-8 | 基因间 | NMUR2,LINC01470 | dist = 208264; dist = 5421 |
RS12522290 | CHR5 | 152797656 | CG | 2.227E-8 | 基因间 | Linc01470,Gria1 | dist = 445747; dist = 72428 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/LINC01470_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。