概括
基因 101927134
象征 LINC01470
同义词 -
描述 长基因间非蛋白质编码RNA 1470
参考 HGNC:HGNC:51105|ENSEMBL:ENSG00000249484|
基因类型 ncRNA
地图位置 5q33.1

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
LK:是的 全基因组协会研究 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV:RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS111294930 CHR5 152177121 Ag 1.312E-9 ncrna_intronic LINC01470
RS2973155 CHR5 152608619 TC 1.016E-9 基因间 Linc01470,Gria1 dist = 256710; dist = 261465
RS79212538 CHR5 151993104 TG 3.843e-8 基因间 NMUR2,LINC01470 dist = 208264; dist = 5421
RS12522290 CHR5 152797656 CG 2.227E-8 基因间 Linc01470,Gria1 dist = 445747; dist = 72428


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因