基因页:mau2
概括?
基因 | 23383 |
象征 | mau2 |
同义词 | kiaa0892 | mau2l | scc4 | mau-2 |
描述 | MAU2姐妹染色质被凝聚因子 |
参考 | MIM:614560|HGNC:HGNC:29140|ENSEMBL:ENSG00000129933|HPRD:11117|Vega:Otthumg00000150188 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19p13.11 |
Pascal P值 | 1.175E-7 |
Sherlock P值 | 0.711 |
胎儿β | 1.287 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
简历:RIPKE_2013 | 全基因组协会研究 | 多阶段GWA,瑞典人口和PGC2。24个领先的SNP | |
LK:是的 | 全基因组协会研究 | 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV:RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:PGC128
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2905426 | CHR19 | 19478022 | TG | 6.921E-9 | 基因间 | Mau2,Gatad2a | dist = 8459; dist = 18620 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11882889 | CHR19 | 19887684 | mau2 | 23383 | 0.14 | 顺式 | ||
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | mau2 | 23383 | 7.731E-6 | 反式 | ||
RS3845734 | CHR2 | 171125572 | mau2 | 23383 | 0.2 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | mau2 | 23383 | 0.08 | 反式 | ||
SNP_A-4218600 | 0 | mau2 | 23383 | 0.19 | 反式 | |||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | mau2 | 23383 | 4.306E-7 | 反式 | ||
RS1230896 | CHR16 | 13196672 | mau2 | 23383 | 0.1 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MAU2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Gaussmann MLL AF4融合靶向 | 191 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MYC增强的Schlosser血清反应 | 108 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durchdewald皮肤致癌DN | 264 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TERAO AOX4靶向皮肤DN | 27 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |