概括
基因 56924
象征 PAK6
同义词 PAK5
描述 P21蛋白(CDC42/RAC)激活激酶6
参考 MIM:608110|HGNC:HGNC:16061|ENSEMBL:ENSG00000137843|HPRD:06426|Vega:Otthumg00000129921
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q14
Pascal P值 1.01E-5
Sherlock P值 0.797
胎儿β -1.583
主持人 伏隔核基底神经节
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
简历:PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS56205728 CHR15 40567237 Ag 4.92E-8 内含子 BUB1B-PAK6,PAK6


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg erbb信号通路 87 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG轴突指导 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg焦点粘附 201 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg t细胞受体信号通路 108 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG肾细胞癌 70 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta AGR途径 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG PIP3在心脏肌周期中发出信号 67 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG趋化性 45 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rho GTPases对肌动蛋白细胞骨架的SIG调节 35 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST整合素信号通路 82 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St T细胞信号转导 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RAC的反应组激活 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Robo受体的反应组信号传导 30 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOOI ST7靶向DN 123 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53和TP63目标 205 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUI MAPK14靶向 21 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1定位DN的Alcalay AML 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sarrio上皮间质转变 180 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner ES ICP与H3K4Me3 34 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC ICP,具有H3未甲基化的 24 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain ICP带有H3K4ME3 32 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 ICP带有H3K27ME3 74 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期g2 m 216 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病持续时间corr dn 146 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因