基因页：PCDH18

概括？
基因 54510
象征 PCDH18
同义词 PCDH68L
描述 原钙粘蛋白18
参考 MIM：608287|HGNC：HGNC：14268|ENSEMBL：ENSG00000189184|HPRD：12205|Vega：Otthumg00000161348
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q31
Pascal P值 0.098
Sherlock P值 0.531
胎儿β 0.828
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
表达 基因表达的荟萃分析 p价值：1.9
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS695809 CHR22 26278127 PCDH18 54510 0.04 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005509 钙离子结合 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 ISS -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007420 大脑发育 ISS 大脑（GO期限：7） -
去：0007155 细胞粘附 IEA -
去：0007156 同粒细胞粘附 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -
去：0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Bertucci髓质与导管乳腺癌DN 169 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
roversi神经胶质瘤副本编号 100 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer Sox9在前列腺发展中的目标DN 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino DN 200 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB目标 74 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体DN 185 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD1 vs CD2 UP 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向DN 115 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMAD1和SMAD5 DN抑制Pangas肿瘤 157 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 229 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
山乳房干细胞DN 146 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-101 138 144 1a HSA-MIR-101 uacaguacugauaacugaag
mir-144 137 144 1A，M8 HSA-MIR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-182 85 92 1A，M8 HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-26 969 976 1A，M8 HSA-MIR-26A脑 Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu
mir-380-5p 318 324 1a HSA-MIR-380-5p ugguugaccauagaacaugcgc
HSA-MIR-563 agguugacauacguuccc
mir-493-5p 152 158 M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-495 1102 1108 1a HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-96 86 92 1a HSA-MIR-96脑 uuuggcacuagcacauuuuugc