概括
基因 5192
象征 PEX10
同义词 nald | pbd6a | pbd6b | rnf69
描述 过氧化物酶体生物发生因子10
参考 MIM:602859|HGNC:HGNC:8851|Ensembl:ENSG00000157911|HPRD:04175|Vega:Otthumg00000001637
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p36.32
Pascal P值 3.436E-6
Sherlock P值 0.933
胎儿β -0.634
DMG 1(#研究)
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
简历:PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS4648845 CHR1 2387101 TC 4.033e-9 基因间 PEX10,PLCH2 dist = 43091; dist = 11797

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG23928726 1 2344998 PEX10 4.106E-4 0.279 0.044 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
na 0.87 0.46
ZIC4 0.85 0.31
FZD10 0.85 0.29
ZIC2 0.84 0.33
ZIC1 0.84 0.35
ID4 0.81 0.38
KRT18P19 0.80 0.28
Prox1 0.80 0.35
CD247 0.78 0.35
GBX2 0.77 0.37
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GTDC1 -0.20 -0.19
AF347015.2 -0.18 -0.20
AF347015.15 -0.18 -0.19
mt-cyb -0.17 -0.19
AF347015.8 -0.17 -0.20
AF347015.27 -0.17 -0.20
MT-ATP8 -0.17 -0.24
AF347015.31 -0.17 -0.19
BCAP29 -0.17 -0.13
SSX2IP -0.17 -0.11

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg过氧化物酶体 78 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
setlur前列腺癌TMPRSS2 ERG融合 67 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Keshelava多种耐药性 88 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因