基因页:PEX10
概括?
基因 | 5192 |
象征 | PEX10 |
同义词 | nald | pbd6a | pbd6b | rnf69 |
描述 | 过氧化物酶体生物发生因子10 |
参考 | MIM:602859|HGNC:HGNC:8851|Ensembl:ENSG00000157911|HPRD:04175|Vega:Otthumg00000001637 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p36.32 |
Pascal P值 | 3.436E-6 |
Sherlock P值 | 0.933 |
胎儿β | -0.634 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
简历:PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:PGC128
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4648845 | CHR1 | 2387101 | TC | 4.033e-9 | 基因间 | PEX10,PLCH2 | dist = 43091; dist = 11797 |
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG23928726 | 1 | 2344998 | PEX10 | 4.106E-4 | 0.279 | 0.044 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PEX10_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
na | 0.87 | 0.46 |
ZIC4 | 0.85 | 0.31 |
FZD10 | 0.85 | 0.29 |
ZIC2 | 0.84 | 0.33 |
ZIC1 | 0.84 | 0.35 |
ID4 | 0.81 | 0.38 |
KRT18P19 | 0.80 | 0.28 |
Prox1 | 0.80 | 0.35 |
CD247 | 0.78 | 0.35 |
GBX2 | 0.77 | 0.37 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GTDC1 | -0.20 | -0.19 |
AF347015.2 | -0.18 | -0.20 |
AF347015.15 | -0.18 | -0.19 |
mt-cyb | -0.17 | -0.19 |
AF347015.8 | -0.17 | -0.20 |
AF347015.27 | -0.17 | -0.20 |
MT-ATP8 | -0.17 | -0.24 |
AF347015.31 | -0.17 | -0.19 |
BCAP29 | -0.17 | -0.13 |
SSX2IP | -0.17 | -0.11 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg过氧化物酶体 | 78 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
setlur前列腺癌TMPRSS2 ERG融合 | 67 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Keshelava多种耐药性 | 88 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |