基因页:PPIL6
概括?
基因 | 285755 |
象征 | PPIL6 |
同义词 | PPIASE | RSPH12 | BA425D10.6 | DJ919F19.1 |
描述 | 肽基丙基异构酶像6 |
参考 | HGNC:HGNC:21557|Ensembl:ENSG00000185250|HPRD:15165|Vega:Otthumg0000000036593 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q21 |
Pascal P值 | 0.402 |
胎儿β | 0.678 |
主持人 | 小脑 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
简历:Phewas | 全球整个关联研究(PHEWAS) | 157个与精神分裂症相关的SNP | 1 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:Phewas
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS9487094 | 6 | 109742015 | 无效的 | 1.798 | PPIL6 | 无效的 |
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG23978557 | 6 | 109760819 | PPIL6; SMPD2 | 1.941E-4 | 0.432 | 0.035 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7773095 | CHR6 | 109727076 | PPIL6 | 285755 | 0.13 | 顺式 | ||
RS17070580 | CHR6 | 109738713 | PPIL6 | 285755 | 0.11 | 顺式 | ||
RS2236582 | CHR6 | 109765817 | PPIL6 | 285755 | 0.1 | 顺式 | ||
RS4241527 | CHR3 | 24487304 | PPIL6 | 285755 | 0.16 | 反式 | ||
RS4858617 | CHR3 | 24487720 | PPIL6 | 285755 | 0.16 | 反式 | ||
RS6897022 | CHR5 | 40336545 | PPIL6 | 285755 | 0.05 | 反式 | ||
RS9292776 | CHR5 | 40437844 | PPIL6 | 285755 | 0.09 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003755 | 肽酰 - 丙酰基传播异构酶活性 | IEA | - | |
GO:0016853 | 异构酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006457 | 蛋白质折叠 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MariaDason对丁酸姜黄素Sulindac TSA 8的反应 | 16 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN | 238 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇6 | 140 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |