概括
基因 285755
象征 PPIL6
同义词 PPIASE | RSPH12 | BA425D10.6 | DJ919F19.1
描述 肽基丙基异构酶像6
参考 HGNC:HGNC:21557|Ensembl:ENSG00000185250|HPRD:15165|Vega:Otthumg0000000036593
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q21
Pascal P值 0.402
胎儿β 0.678
主持人 小脑
皮质
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历:Phewas 全球整个关联研究(PHEWAS) 157个与精神分裂症相关的SNP 1
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:Phewas

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS9487094 6 109742015 无效的 1.798 PPIL6 无效的

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG23978557 6 109760819 PPIL6; SMPD2 1.941E-4 0.432 0.035 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7773095 CHR6 109727076 PPIL6 285755 0.13 顺式
RS17070580 CHR6 109738713 PPIL6 285755 0.11 顺式
RS2236582 CHR6 109765817 PPIL6 285755 0.1 顺式
RS4241527 CHR3 24487304 PPIL6 285755 0.16 反式
RS4858617 CHR3 24487720 PPIL6 285755 0.16 反式
RS6897022 CHR5 40336545 PPIL6 285755 0.05 反式
RS9292776 CHR5 40437844 PPIL6 285755 0.09 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003755 肽酰 - 丙酰基传播异构酶活性 IEA -
GO:0016853 异构酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006457 蛋白质折叠 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌DN 349 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MariaDason对丁酸姜黄素Sulindac TSA 8的反应 16 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN 238 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向 295 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇6 140 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因