基因页面:PTPRD
总结吗?
| GeneID | 5789年 |
| 象征 | PTPRD |
| 同义词 | HPTP | HPTPD | HPTPDELTA | PTPD | RPTPDELTA |
| 描述 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶,受体D型 |
| 参考 | MIM: 601598|HGNC: HGNC: 9668|运用:ENSG00000153707|HPRD: 03358|织女:OTTHUMG00000021005 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 9 p23-p24.3 |
| 夏洛克假定值 | 0.122 |
| 胎儿β | 1.19 |
| DMG | 2(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP CompositeSet 达内尔FMRP目标 潜在的突触基因 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 简历:PheWAS | Phenome-wide协会研究(PheWAS) | 157个snp与精神分裂症有关 | 2 |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 3 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 3 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
简历:PheWAS
简历:PheWAS| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | P | 函数 | 基因 | 上/下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs1975197 | 9 | 8846955 | 零 | 1.948 | PTPRD | 零 | |
| rs17584499 | 9 | 8879118 | 零 | 1.677 | PTPRD | 零 |
不同甲基化基因
| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ch.9.178852F | 9 | 8739553 | PTPRD | 2.815的军医 | -0.61 | 0.039 | DMG: Wockner_2014 |
| cg14439952 | 9 | 8852055 | PTPRD | 3.21的军医 | -0.599 | 0.04 | DMG: Wockner_2014 |
| cg08719869 | 9 | 8857486 | PTPRD | 1.29 e-8 | -0.01 | 5.18 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs10931362 | chr2 | 153744261 | PTPRD | 5789年 | 0.17 | 反式 | ||
| rs1761450 | chr19 | 54818034 | PTPRD | 5789年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs9637082 | chr21 | 21213235 | PTPRD | 5789年 | 0 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| GAZDA钻石BLACKFAN贫血祖DN | 66年 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 开回应前列腺素E2 DN | 391年 | 222年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DAVICIONI分子武器VS erm | 332年 | 228年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 武田的目标NUP98 HOXA9融合3 d | 182年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗德里格斯甲状腺未分化癌DN | 537年 | 339年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAUSSMANN MLL AF4融合目标C | 170年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SNIJDERS放大在头部和颈部肿瘤 | 37 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SILIGAN受EWS FLT1融合 | 47 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 道森在淋巴瘤TCL1甲基化 | 59 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHETH肝癌VS TXNIP PAM4损失 | 261年 | 153年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN | 514年 | 330年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 丁肺癌显著变异 | 26 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FLECHNER活检肾移植排斥和好的DN | 546年 | 351年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FLECHNER活检肾移植好的VS捐赠 | 555年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 哈达德T淋巴细胞及NK祖 | 78年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 松田自然杀伤细胞分化 | 475年 | 313年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃早期造血祖 | 532年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒20小时 | 240年 | 152年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李卡路里限制大脑皮层 | 83年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李老化小脑DN | 86年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染48小时血巨细胞病毒DN | 504年 | 323年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒18 hr DN | 178年 | 121年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 麦克朗CREB1目标了 | One hundred. | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒10人力资源 | 101年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BAELDE糖尿病肾病DN | 434年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 巨噬细胞培养宽容DN | 409年 | 268年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| STEARMAN肺癌早期和晚期 | 125年 | 89年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由喀斯特IWANAGA致癌PTEN DN | 353年 | 226年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 营地结肠癌拷贝数 | 92年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BONOME卵巢癌生存非最优减积 | 510年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 郑胶质母细胞瘤可塑性高 | 250年 | 168年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOQUEST干细胞起 | 260年 | 174年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOQUEST干细胞培养与新鲜 | 425年 | 298年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 研究包括 | 420年 | 269年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 甜蜜的肺癌喀斯特DN | 435年 | 289年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 丁肺癌突变率 | 20. | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 么时间响应黄体酮集群15 | 35 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PILON KLF1目标了 | 504年 | 321年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 | 898年 | 516年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李BMP2目标了 | 745年 | 475年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| IKEDA MIR133目标了 | 43 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PLASARI TGFB1目标10人力资源DN | 244年 | 157年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |