基因页：SDCCAG8
概括？
| 基因 | 10806 |
| 象征 | SDCCAG8 |
| 同义词 | BBS16 | CCCAP | CCCAP SLSN7 | HSPC085 | NPHP10 | NY-CO-8 | SLSN7 | HCCCAP |
| 描述 | 血清学定义的结肠癌抗原8 |
| 参考 | MIM：613524|HGNC：HGNC：10671|ENSEMBL：ENSG00000054282|HPRD：10215|Vega：Otthumg0000000039996 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q43 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| 简历：RIPKE_2013 | 全基因组协会研究 | 多阶段GWA，瑞典人口和PGC2。24个领先的SNP | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
| LK：是的 | 全基因组协会研究 | 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV：RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历：PGC128
简历：PGC128| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS77149735 | CHR1 | 243555105 | Ag | 4.404e-9 | 内含子 | SDCCAG8 | |
| RS10803138 | CHR1 | 243555219 | Ag | 1.788e-8 | 内含子 | SDCCAG8 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG06882058 | 1 | 243646787 | SDCCAG8 | 2.04e-4 | 0.418 | 0.035 | DMG：Wockner_2014 |
| CG16104450 | 1 | 243645911 | SDCCAG8 | 4.529E-4 | 0.349 | 0.045 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PLSCR1 | 0.93 | 0.86 |
| PARP9 | 0.91 | 0.88 |
| ifit3 | 0.89 | 0.82 |
| IRF9 | 0.86 | 0.77 |
| TAP1 | 0.85 | 0.75 |
| ifit1 | 0.85 | 0.76 |
| SP110 | 0.84 | 0.82 |
| MX1 | 0.84 | 0.78 |
| ifih1 | 0.83 | 0.84 |
| HERC5 | 0.82 | 0.85 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SPTAN1 | -0.44 | -0.52 |
| PELP1 | -0.43 | -0.54 |
| Neurl4 | -0.43 | -0.54 |
| KIAA1543 | -0.43 | -0.58 |
| Nova2 | -0.43 | -0.55 |
| DPF1 | -0.43 | -0.58 |
| RUSC1 | -0.42 | -0.55 |
| TUBGCP2 | -0.42 | -0.53 |
| jag2 | -0.42 | -0.51 |
| Fasn | -0.42 | -0.57 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞周期有丝分裂 | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome募集有丝分裂的中心体蛋白和复合物 | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 来自有丝分裂中心体NLP的反应组损失 | 59 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome有丝分裂G2 G2 M相 | 81 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| THUM收缩心力衰竭DN | 244 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TCGA胶质母细胞瘤副本编号 | 75 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU GH1外源目标DN | 120 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村转移 | 47 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |