概括
基因 220963
象征 SLC16A9
同义词 C10ORF36 | MCT9
描述 Solute Carrier家族16成员9
参考 MIM:614242|HGNC:HGNC:23520|ENSEMBL:ENSG00000165449|HPRD:15348|Vega:Otthumg0000000018283
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q21.2
Pascal P值 0.2
Sherlock P值 0.265
胎儿β 1.255
主持人 小脑半球
小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历:Phewas 全球整个关联研究(PHEWAS) 157个与精神分裂症相关的SNP 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:Phewas

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS12356193 10 61413353 无效的 1.717 SLC16A9 无效的

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17776046 Chr10 61412200 SLC16A9 220963 0.2 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tomida转移 26 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞长期 302 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP 295 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌DN 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEKI炎症反应LPS DN 23 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANASSE BCL2靶向 40 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向DN 115 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ivanovska mir106b目标 90 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Linsley mir16目标 206 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向 266 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 308 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因