基因页：SMG1

概括？
基因 23049
象征 SMG1
同义词 61e3.4 | atx |唇
描述 SMG1磷脂酰肌醇3-激酶相关激酶
参考 MIM：607032|HGNC：HGNC：30045|ENSEMBL：ENSG00000157106|HPRD：06123|Vega：Otthumg00000166900
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16p12.3
Pascal P值 0.166
Sherlock P值 0.203
胎儿β 1.941
主持人 小脑半球
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） PSR：0.01775

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1548445 CHR16 19691582 SMG1 23049 0.13 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZNF629 0.93 0.93
NAV1 0.93 0.95
ZMIZ1 0.93 0.92
SH3PXD2B 0.93 0.93
DLG5 0.92 0.93
BAT2L 0.92 0.92
KIAA1549 0.91 0.92
JRK 0.91 0.93
Arid1b 0.91 0.93
TBC1D16 0.91 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.67 -0.77
AF347015.31 -0.66 -0.86
AF347015.27 -0.64 -0.83
MT-CO2 -0.64 -0.84
S100B -0.63 -0.77
FXYD1 -0.63 -0.79
AF347015.33 -0.62 -0.79
ifi27 -0.62 -0.77
higd1b -0.62 -0.80
mt-cyb -0.61 -0.80

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005515 蛋白质结合 IPI 11544179
去：0004428 肌醇或磷脂酰肌醇激酶活性 艾达 11331269
去：0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 艾达 11544179|15175154
去：0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 nas 11331269
GO：0016740 转移酶活性 IEA -
GO：0030145 锰离子结合 IEA -
GO：0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0000184 核转录的mRNA分解代谢过程，废话介导的衰减 艾达 11544179
去：0000184 核转录的mRNA分解代谢过程，废话介导的衰减 nas 11331269
去：0000184 核转录的mRNA分解代谢过程，废话介导的衰减 塔斯 16488880
去：0006406 核中的mRNA导出 塔斯 16488880
去：0006281 DNA修复 IEA -
GO：0018105 肽基丝氨酸磷酸化 艾达 11544179|15175154
GO：0018105 肽基丝氨酸磷酸化 塔斯 14636577
GO：0046854 磷酸肌醇磷酸化 艾达 11331269
GO：0046777 蛋白氨基酸自磷酸化 艾达 11331269|11544179
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 艾达 14636577|15175154
去：0005737 细胞质 我知道了 11331269
去：0005737 细胞质 艾达 14636577|15175154

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
mRNA的反应组代谢 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胡说八道介导的衰减由外显子连接络合物增强 176 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂的反应绿松石 79 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向 238 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧化物素的浓凋亡 239 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园HSC vs多能祖先 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
康（Kang）由tert dn永生 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Radmacher AML预后 78 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染20小时 240 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧正常 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD CTNNB1致癌特征 82 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞 156 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D DN 270 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性2D DN 64 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布（McCabe）由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bredemeyer抹布发信号不是通过ATM提高 62 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
突变率丁肺癌 20 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移 221 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF间隔 105 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 351 357 1a HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-125/351 175 182 1A，M8 HSA-MIR-125B脑 ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A脑 ucccugagacccuuaaccugug
mir-128 888 894 M8 HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-138 4573 4579 M8 HSA-MIR-138脑 Agcugguuguguugaauc
mir-142-3p 589 596 1A，M8 HSA-MIR-142-3P uguaguuuccuacuuuaugga
mir-216 3147 3153 M8 HSA-MIR-216 uaaucucagcuggcaacugug
mir-30-3p 4583 4589 1a HSA-MIR-30A-3P cuuucagucggauguugcagc
HSA-MIR-30E-3P cuuucagucggauguauacagc
mir-329 367 373 1a HSA-MIR-329脑 aacacaccugguaaccucuuu
mir-33 3432 3439 1A，M8 HSA-MIR-33 Gugcauuguuguugcauug
HSA-MIR-33B Gugcauugcuguugcauugca
mir-362 791 797 M8 HSA-MIR-362 aauccuuggaaccuaggugugugugugugagu
mir-377 3385 3391 1a HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-384 145 151 M8 HSA-MIR-384 auuccuagaaauuguucaua
HSA-MIR-384 auuccuagaaauuguucaua
mir-485-3p 4662 4669 1A，M8 HSA-MIR-485-3P gucauacgggcucucucucucucu
mir-485-5p 59 66 1A，M8 HSA-MIR-485-5p aggcuggccgugaugauuc
mir-490 3221 3227 M8 HSA-MIR-490 caaccuggaggacuaugcugcug
mir-493-5p 867 873 M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-504 210 217 1A，M8 HSA-MIR-504 agacccugucugcacucuau
mir-7 3522 3528 M8 HSA-MIR-7SZ Uggaagacuaguuuuuguug