基因页面:SRR

总结吗?
GeneID 63826年
象征 SRR
同义词 ILV1 | ISO1
描述 丝氨酸消旋酶
参考 MIM: 606477|HGNC: HGNC: 14398|运用:ENSG00000167720|HPRD: 10451|织女:OTTHUMG00000090583
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 17 p13
帕斯卡假定值 4.714 e-8
胎儿β 1.148
eGene 前扣带皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
下丘脑
迈尔斯的顺式和反式
元
支持 G2Cdb.humanPSD
G2Cdb.humanPSP
潜在的突触基因

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:GWAScat 全基因组关联研究 这个数据集包含560个snp与精神分裂症有关。总共有486个基因映射到这些snp在50 kb。
简历:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症GWASdb记录
简历:PGC128 全基因组关联研究 一个多阶段精神分裂症GWAS的36989例和113075控制。包括精神分裂症工作组的报告。128年独立协会跨越108位点
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
协会 综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究 2 链接到SZGene
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,精神分裂症患者,神经 点击显示详细信息

部分即遗传学和表观遗传学注释

@简历:PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 P 函数 基因 上/下距离
rs4523957 chr17 2208899 TG 1.04 e-9 intronic SRR

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs16952025 chr17 2116797 SRR 63826年 0.06 独联体
rs17834563 chr17 2172709 SRR 63826年 0.03 独联体
rs1885987 chr17 2203024 SRR 63826年 0.09 独联体
rs3744270 17 2207326 SRR ENSG00000167720.8 4.01456 e - 0.01 -3004年 gtex_brain_ba24
rs12450028 17 2207425 SRR ENSG00000167720.8 3.91241 e - 0.01 -2905年 gtex_brain_ba24
rs77530532 17 2208874 SRR ENSG00000167720.8 6.20043 e - 0.01 -1456年 gtex_brain_ba24
rs116875739 17 2211001 SRR ENSG00000167720.8 1.20948 e-6 0.01 671年 gtex_brain_ba24

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0016853 异构酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0018114 苏氨酸消旋酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0030170 磷酸吡哆醛绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0030378 丝氨酸消旋酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0008152 代谢过程 国际能源机构 - - - - - -
去:0006563 L-serine代谢过程 NAS 11054547

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG甘氨酸丝氨酸和苏氨酸代谢 31日 26 所有SZGR 2.0基因通路
GAZDA钻石BLACKFAN贫血红细胞DN 493年 298年 所有SZGR 2.0基因通路
金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 1278年 748年 所有SZGR 2.0基因通路
由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 1142年 669年 所有SZGR 2.0基因通路
GRAESSMANN MC和阿霉素 612年 367年 所有SZGR 2.0基因通路
LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数 181年 108年 所有SZGR 2.0基因通路
APPIERTO FENRETINIDE反应 38 26 所有SZGR 2.0基因通路
SHETH肝癌VS TXNIP PAM4损失 261年 153年 所有SZGR 2.0基因通路
鲜明的前额叶皮层22 q11删除DN 517年 309年 所有SZGR 2.0基因通路
不知道背景目标2 256年 159年 所有SZGR 2.0基因通路
RODWELL老化肾脏没有血液DN 150年 93年 所有SZGR 2.0基因通路
通过NOVA2 ULE拼接 43 38 所有SZGR 2.0基因通路
RODWELL老化肾脏DN 145年 88年 所有SZGR 2.0基因通路
张乳腺癌祖细胞DN 145年 93年 所有SZGR 2.0基因通路
马顿斯维甲酸反应DN 841年 431年 所有SZGR 2.0基因通路
约翰斯通PARVB目标3 DN 918年 550年 所有SZGR 2.0基因通路
FEVR CTNNB1目标了 682年 433年 所有SZGR 2.0基因通路
PURBEY CTBP1不是SATB1 DN的目标 448年 282年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 140 689年 696年 1、m8 hsa - mir - 140大脑 AGUGGUUUUACCCUAUGGUAG
mir - 146 669年 675年 1 hsa - mir - 146 a UGAGAACUGAAUUCCAUGGGUU
hsa - mir - 146 b大脑 UGAGAACUGAAUUCCAUAGGCU
mir - 216 453年 459年 m8 hsa - mir - 216 UAAUCUCAGCUGGCAACUGUG
mir - 299 - 5 - p 688年 694年 1 hsa - mir - 299 - 5 - p UGGUUUACCGUCCCACAUACAU
mir - 378 * 403年 409年 m8 hsa - mir - 422 b CUGGACUUGGAGUCAGAAGGCC
hsa - mir - 422 a CUGGACUUAGGGUCAGAAGGCC
mir - 421 941年 947年 m8 hsa - mir - 421 GGCCUCAUUAAAUGUUUGUUG