基因页：Stag1
概括？
| 基因 | 10274 |
| 象征 | Stag1 |
| 同义词 | SA1 | SCC3A |
| 描述 | 基质抗原1 |
| 参考 | MIM：604358|HGNC：HGNC：11354|Ensembl：ENSG00000118007|HPRD：05076|Vega：Otthumg00000159798 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3Q22.3 |
| Pascal P值 | 1.006E-6 |
| TADA P值 | 0.017 |
| 胎儿β | 1.963 |
| 支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| 简历：PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中，通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历：PGC128
简历：PGC128| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7432375 | CHR3 | 136288405 | Ag | 5.274e-11 | 内含子 | Stag1 |
DNM表
| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Stag1 | CHR3 | 136240064 | t | 一个 | NM_005862 | p.223t> s | 错过 | 精神分裂症 | DNM：XU_2012 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Cyth2 | 0.91 | 0.91 |
| PES1 | 0.91 | 0.92 |
| PHF23 | 0.90 | 0.91 |
| NOC2L | 0.89 | 0.91 |
| PRPF31 | 0.89 | 0.90 |
| SFRS9 | 0.89 | 0.90 |
| TMed9 | 0.89 | 0.90 |
| DBNL | 0.89 | 0.90 |
| BYSL | 0.89 | 0.90 |
| CCT7 | 0.88 | 0.91 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.79 | -0.83 |
| AF347015.33 | -0.78 | -0.83 |
| AF347015.31 | -0.78 | -0.82 |
| mt-cyb | -0.77 | -0.83 |
| AF347015.27 | -0.77 | -0.83 |
| AF347015.8 | -0.75 | -0.82 |
| AF347015.9 | -0.73 | -0.85 |
| AF347015.15 | -0.73 | -0.82 |
| AF347015.2 | -0.73 | -0.81 |
| AF347015.21 | -0.72 | -0.80 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg细胞周期 | 128 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome减数分裂 | 116 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞周期有丝分裂 | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome有丝分裂M M G1相 | 172 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome染色体维护 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome DNA复制 | 192 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组有丝分裂起点 | 87 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Meiotic Synapsis | 73 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 弗雷索莫昔芬反应 | 51 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Puiffe入侵被腹水DN抑制 | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 | 170 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gajate对Trabectedin DN的响应 | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| de yy1靶向DN | 92 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标36小时DN | 185 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PYEON CANCAR CANCAR HEAD和NECK与颈椎 | 193 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 惠特菲尔德细胞周期M G1 | 148 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标2 DN | 336 | 211 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 | 289 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |