基因页：TCF4
概括?
| 基因ID | 6925 |
| Symbol | TCF4 |
| 同义词 | E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 |
| 描述 | transcription factor 4 |
| 参考 | MIM：602272|HGNC：HGNC：11634|ENSEMBL：ENSG00000196628|HPRD:03780|Vega:OTTHUMG00000132713 |
| 基因type | protein-coding |
| 地图位置 | 18Q21.1 |
| Pascal P值 | 8.651E-6 |
| Fetal beta | 0.823 |
| eGene | 小脑半球 |
| 支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP targets |
数据源中的基因
| 基因set name | 基因组方法 | 描述 | Info |
|---|---|---|---|
| CV:GWAScat | 全基因组关联研究 | This data set includes 560 SNPs associated with schizophrenia. A total of 486 genes were mapped to these SNPs within 50kb. | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | gwasdbrecords for schizophrenia | |
| CV:PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
| Expression | 基因表达的荟萃分析 | Pvalue: 2.26 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias | Click to show details |
第一节遗传学和表观遗传学注释
CV:PGC128
CV:PGC128| SNP ID | Chromosome | Position | 等位基因 | P | Function | 基因 | Up/Down Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs9636107 | chr18 | 53200117 | AG | 9.091E-13 | 内含子 | TCF4 | |
| RS72934570 | chr18 | 53533189 | TC | 3.667E-12 | intergenic | TCF4,LINC01416 | dist = 229965; dist = 15730 |
| RS78322266 | chr18 | 53063676 | TG | 1.099E-8 | 内含子 | TCF4 |
Section II. Transcriptome annotation
基因ral gene expression (GTEx)
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
大脑区域没有共表达基因
Section III. Gene Ontology annotation
| Molecular function | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003700 | 转录因子活性 | 艾达 | 2105528 | |
| GO:0005515 | protein binding | 新闻学会 | 9824680|10903890|11955446 |16630820 |
|
| GO:0046982 | protein heterodimerization activity | NAS | 2105528 | |
| Biological process | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| GO:0045893 | positive regulation of transcription, DNA-dependent | 艾达 | 2105528 | |
| 细胞分量 | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| GO:0005634 | 核 | 塔斯 | 1681116 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| AR | AIS |DHTR |Humara |KD |NR3C4 |SBMA |smax1 |TFM | androgen receptor | - | HPRD，Biogrid | 12799378 |
| ASCL1 | Ash1 |hash1 |mash1 |BHLHA46 | achaete-scute complex homolog 1 (Drosophila) | - | HPRD，Biogrid | 10903890 |
| ASCL3 | 哈希3 |sgn1 |BHLHA42 | Achaete-Scute复合物同源3（果蝇） | - | HPRD | 11784080 |
| 平静1 | Calml2 |CAMI |DD132 |PHKD | calmodulin 1 (phosphorylase kinase, delta) | - | HPRD，Biogrid | 10757985 |
| CALM2 | CAMII | PHKD | PHKD2 | calmodulin 2 (phosphorylase kinase, delta) | - | HPRD | 10757985 |
| CALM3 | PHKD |PHKD3 | 钙调蛋白3（磷酸化酶激酶，三角洲） | - | HPRD | 10757985 |
| CTNNB1 | CTNNB | DKFZp686D02253 | FLJ25606 | FLJ37923 | catenin (cadherin-associated protein), beta 1, 88kDa | - | HPRD | 11713476|12861022 |
| CTNNB1 | CTNNB | DKFZp686D02253 | FLJ25606 | FLJ37923 | catenin (cadherin-associated protein), beta 1, 88kDa | Affinity Capture-Western Co-crystal Structure Reconstituted Complex |
BioGRID | 11713475|11713476 |12657632|15331612 |
| HBP1 | FLJ16340 | HMG-box转录因子1 | - | HPRD，Biogrid | 11500377 |
| ID1 | id |BHLHB24 | inhibitor of DNA binding 1, dominant negative helix-loop-helix protein | 两个杂交 | BioGRID | 9242638|9584154 |
| ID2 | gig8 |ID2A |ID2H |MGC26389 |BHLHB26 | inhibitor of DNA binding 2, dominant negative helix-loop-helix protein | - | HPRD，Biogrid | 9242638 |
| ID3 | 继承人1 |BHLHB25 | inhibitor of DNA binding 3, dominant negative helix-loop-helix protein | - | HPRD，Biogrid | 8999959 |
| lyl1 | bHLHa18 | 淋巴细胞白血病衍生序列1 | 两个杂交 | BioGRID | 9242638 |
| MSC | ABF-1 | ABF1 | MYOR | bHLHa22 | musculin (activated B-cell factor-1) | 两个杂交 | BioGRID | 9584154 |
| myod1 | myf3 |Myod |PUM |BHLHC1 | 肌源分化1 | - | HPRD，Biogrid | 8576241|8999959 |
| RUNX1T1 | AML1T1 |CBFA2T1 |CDR |Eto |MGC2796 |mtg8 |mtg8b |zmynd2 | runt-related transcription factor 1; translocated to, 1 (cyclin D-related) | ETO interacts with E2-2. | BIND | 15333839 |
| TAL1 | SCL | TCL5 | bHLHa17 | tal-1 | T细胞急性淋巴细胞性白血病1 | 亲和力捕获ms Reconstituted Complex 两个杂交 |
BioGRID | 8576241|9242638 |16407974 |
| TAL2 | bHLHa19 | T细胞急性淋巴细胞性白血病2 | 两个杂交 | BioGRID | 9242638 |
| TCF3 | e2a |itf1 |MGC129647 |MGC129648 |BHLHB21 | transcription factor 3 (E2A immunoglobulin enhancer binding factors E12/E47) | - | HPRD | 8999959 |
| TCF4 | E2-2 | ITF2 | MGC149723 | MGC149724 | PTHS | SEF2 | SEF2-1 | SEF2-1A | SEF2-1B | bHLHb19 | transcription factor 4 | - | HPRD，Biogrid | 8999959|9668116 |
V.途径注释
| Pathway name | Pathway size | ＃szgr 2.0基因 | Info |
|---|---|---|---|
| PID AR PATHWAY | 61 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Beta Catenin nuc途径 | 80 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME MYOGENESIS | 28 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL UP | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过CD40 DN的Hollmann凋亡 | 267 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SCHUETZ BREAST CANCER DUCTAL INVASIVE UP | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DAVICIONI PAX FOXO1 SIGNATURE IN ARMS DN | 20 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FOURNIER ACINAR DEVELOPMENT LATE UP | 11 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DAVICIONI TARGETS OF PAX FOXO1 FUSIONS DN | 68 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DAVICIONI RHABDOMYOSARCOMA PAX FOXO1 FUSION DN | 15 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GARY CD5 TARGETS UP | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Laiho结直肠癌锯齿状 | 112 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| OSWALD HEMATOPOIETIC STEM CELL IN COLLAGEN GEL UP | 233 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoebeke淋巴干细胞向上 | 95 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1靶向DN | 260 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SENESE HDAC1 AND HDAC2 TARGETS DN | 232 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SENESE HDAC3 TARGETS DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TIEN INTESTINE PROBIOTICS 6HR DN | 167 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graham CML划分与正常静止DN | 95 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WAMUNYOKOLI OVARIAN CANCER LMP DN | 199 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HAHTOLA MYCOSIS FUNGOIDES SKIN UP | 177 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV RESPONSE EPIDERMIS DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GAUSSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS C UP | 170 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA DN | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TANG SENESCENCE TP53 TARGETS DN | 57 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HAMAI APOPTOSIS VIA TRAIL UP | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARTORIATI MDM4 TARGETS FETAL LIVER DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM1 | 229 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUYTTEN NIPP1 TARGETS UP | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUYTTEN EZH2 TARGETS UP | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 48HR DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer Sox9在前列腺发展中的目标DN | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH OCT4 TARGETS | 290 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| POMEROY MEDULLOBLASTOMA DESMOPLASIC VS CLASSIC DN | 59 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMITH TERT TARGETS DN | 87 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 DN | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PARK HSC MARKERS | 44 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FERRANDO T ALL WITH MLL ENL FUSION UP | 87 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HADDAD B LYMPHOCYTE PROGENITOR | 293 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Radmacher AML预后 | 78 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| IVANOVA HEMATOPOIESIS STEM CELL | 254 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR UP | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR DN | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性5 | 482 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 | 88 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向DN | 292 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 | 281 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| IWANAGA CARCINOGENESIS BY KRAS DN | 120 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 替代转移 | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID BREAST CANCER NORMAL LIKE UP | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| IZADPANAH STEM CELL ADIPOSE VS BONE DN | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LABBE TGFB1 TARGETS UP | 102 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RAY TUMORIGENESIS BY ERBB2 CDC25A DN | 159 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BLUM RESPONSE TO SALIRASIB DN | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GU PDEF目标 | 71 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SWEET LUNG CANCER KRAS DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LEE RECENT THYMIC EMIGRANT | 227 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HOSHIDA LIVER CANCER LATE RECURRENCE UP | 62 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌生存 | 73 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nielsen Leiomomyosarcoma CNN1 DN | 20 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KAMIKUBO MYELOID MN1 NETWORK | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hirsch细胞转化特征dn | 103 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad1和Smad5抑制Pangas肿瘤 | 134 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BRUINS UVC RESPONSE LATE | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KOINUMA TARGETS OF SMAD2 OR SMAD3 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PHONG TNF RESPONSE VIA P38 COMPLETE | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZWANG TRANSIENTLY UP BY 1ST EGF PULSE ONLY | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |