基因页：TMPRSS5
概括？
| 基因 | 80975 |
| 象征 | TMPRSS5 |
| 同义词 | 棘突 |
| 描述 | 跨膜蛋白酶，丝氨酸5 |
| 参考 | MIM：606751|HGNC：HGNC：14908|ENSEMBL：ENSG00000166682|HPRD：05995|Vega：Otthumg00000168186 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11q |
| Pascal P值 | 0.15 |
| 胎儿β | -0.87 |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 下丘脑 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| 简历：PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.006 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历：PGC128
简历：PGC128| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2514218 | Chr11 | 113392994 | TC | 4.091E-10 | 基因间 | DRD2，TMPRSS5 | dist = 46993; dist = 165274 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2885987 | Chr11 | 113602554 | TMPRSS5 | 80975 | 0 | 顺式 | ||
| RS17115918 | Chr11 | 113613757 | TMPRSS5 | 80975 | 0 | 顺式 | ||
| RS10789970 | Chr11 | 113773945 | TMPRSS5 | 80975 | 0.16 | 顺式 | ||
| RS737518 | CHR2 | 2734669 | TMPRSS5 | 80975 | 0.19 | 反式 | ||
| RS264672 | CHR3 | 65880606 | TMPRSS5 | 80975 | 1.213E-6 | 反式 | ||
| RS1165892 | CHR3 | 103844929 | TMPRSS5 | 80975 | 0.14 | 反式 | ||
| RS12651357 | CHR4 | 53029658 | TMPRSS5 | 80975 | 0.08 | 反式 | ||
| RS9996479 | CHR4 | 53029771 | TMPRSS5 | 80975 | 0.08 | 反式 | ||
| RS4544841 | CHR5 | 95491996 | TMPRSS5 | 80975 | 0.2 | 反式 | ||
| RS17053975 | Chr9 | 90836064 | TMPRSS5 | 80975 | 0.15 | 反式 | ||
| RS11192251 | Chr10 | 83798240 | TMPRSS5 | 80975 | 0.04 | 反式 | ||
| RS11192252 | Chr10 | 83798258 | TMPRSS5 | 80975 | 0.13 | 反式 | ||
| RS7073610 | Chr10 | 102006624 | TMPRSS5 | 80975 | 0.01 | 反式 | ||
| RS2885987 | Chr11 | 113602554 | TMPRSS5 | 80975 | 0.08 | 反式 | ||
| RS17115918 | Chr11 | 113613757 | TMPRSS5 | 80975 | 0.09 | 反式 | ||
| RS17730330 | CHR12 | 92998513 | TMPRSS5 | 80975 | 0.19 | 反式 | ||
| RS17630491 | CHR13 | 41292492 | TMPRSS5 | 80975 | 0.11 | 反式 | ||
| RS3863293 | 11 | 113582504 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 6.22e-7 | 0.01 | -5409 | gtex_brain_ba24 |
| RS4083004 | 11 | 113582634 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 6.22e-7 | 0.01 | -5539 | gtex_brain_ba24 |
| RS4471465 | 11 | 113583690 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 1.203E-6 | 0.01 | -6595 | gtex_brain_ba24 |
| RS12279366 | 11 | 113585256 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 6.22e-7 | 0.01 | -8161 | gtex_brain_ba24 |
| RS12273259 | 11 | 113585370 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 6.22e-7 | 0.01 | -8275 | gtex_brain_ba24 |
| RS12292853 | 11 | 113585782 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 5.131E-7 | 0.01 | -8687 | gtex_brain_ba24 |
| RS3914060 | 11 | 113586757 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 6.22e-7 | 0.01 | -9662 | gtex_brain_ba24 |
| RS4938050 | 11 | 113590031 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 6.22e-7 | 0.01 | -12936 | gtex_brain_ba24 |
| RS7114297 | 11 | 113591402 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 6.22e-7 | 0.01 | -14307 | gtex_brain_ba24 |
| RS75601171 | 11 | 113506551 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 1.974E-6 | 0 | 70544 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS151155465 | 11 | 113519175 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 4.317E-8 | 0 | 57920 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12291314 | 11 | 113520200 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 7.414e-8 | 0 | 56895 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS876378 | 11 | 113521593 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 4.355e-8 | 0 | 55502 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS74939839 | 11 | 113533742 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 4.317E-8 | 0 | 43353 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11214704 | 11 | 113562750 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 3.856e-8 | 0 | 14345 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS45503699 | 11 | 113566327 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 7.447E-10 | 0 | 10768 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS72103801 | 11 | 113569927 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 4.494E-9 | 0 | 7168 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS73568808 | 11 | 113570208 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 2.744e-10 | 0 | 6887 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3802854 | 11 | 113570852 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 7.086e-11 | 0 | 6243 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS111627504 | 11 | 113573461 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 5.529e-11 | 0 | 3634 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2089653 | 11 | 113573837 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 2.021E-9 | 0 | 3258 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2089652 | 11 | 113573914 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 5.395e-11 | 0 | 3181 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4553400 | 11 | 113574703 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 5.249e-11 | 0 | 2392 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3902836 | 11 | 113574840 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 5.233e-11 | 0 | 2255 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3907855 | 11 | 113577533 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 2.323E-10 | 0 | -438 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12285469 | 11 | 113581816 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 2.327E-10 | 0 | -4721 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3863293 | 11 | 113582504 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 1.158e-13 | 0 | -5409 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4083004 | 11 | 113582634 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 1.158e-13 | 0 | -5539 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4259857 | 11 | 113583491 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 2.327E-10 | 0 | -6396 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4471465 | 11 | 113583690 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 8.457e-14 | 0 | -6595 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12279366 | 11 | 113585256 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 1.158e-13 | 0 | -8161 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12273259 | 11 | 113585370 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 3.576E-13 | 0 | -8275 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12292722 | 11 | 113585371 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 1.023E-9 | 0 | -8276 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12292878 | 11 | 113585626 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 2.327E-10 | 0 | -8531 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12292853 | 11 | 113585782 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 1.034E-13 | 0 | -8687 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3914060 | 11 | 113586757 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 1.158e-13 | 0 | -9662 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS17115875 | 11 | 113587738 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 2.327E-10 | 0 | -10643 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS61345035 | 11 | 113587882 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 2.327E-10 | 0 | -10787 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11214711 | 11 | 113588082 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 2.327E-10 | 0 | -10987 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11195658 | 11 | 113588652 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 2.327E-10 | 0 | -11557 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4938050 | 11 | 113590031 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 1.158e-13 | 0 | -12936 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7114297 | 11 | 113591402 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 1.158e-13 | 0 | -14307 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12577772 | 11 | 113591532 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 1.578E-9 | 0 | -14437 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12295777 | 11 | 113592223 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 2.307E-10 | 0 | -15128 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS73551130 | 11 | 113592489 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 2.294E-10 | 0 | -15394 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS398045598 | 11 | 113616733 | TMPRSS5 | ENSG00000166682.6 | 2.365E-7 | 0 | -39638 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004252 | 丝氨酸型内肽酶活性 | IEA | 谷氨酸（GO期限：7） | - |
| 去：0005044 | 清道夫受体活性 | IEA | - | |
| 去：0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006508 | 蛋白水解 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |