基因页面:TNFRSF11B
总结吗?
GeneID | 4982年 |
象征 | TNFRSF11B |
同义词 | 功能OCIF | | PDB5 | TR1 |
描述 | 肿瘤坏死因子受体超家族成员11 b |
参考 | MIM: 602643|HGNC: HGNC: 11909|运用:ENSG00000164761|HPRD: 04032|织女:OTTHUMG00000164969 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 8抓起 |
帕斯卡假定值 | 0.197 |
胎儿β | -0.652 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
简历:PheWAS | Phenome-wide协会研究(PheWAS) | 157个snp与精神分裂症有关 | 3 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
简历:PheWAS
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | P | 函数 | 基因 | 上/下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
rs6993813 | 8 | 120052238 | 零 | 0.6515 | TNFRSF11B | 零 | |
rs4355801 | 8 | 119923873 | 零 | 0.6482 | TNFRSF11B | 零 | |
rs6469804 | 8 | 120044829 | 零 | 0.6666 | TNFRSF11B | 零 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs17131472 | chr1 | 91962966 | TNFRSF11B | 4982年 | 2.161的军医 | 反式 | ||
rs546975 | chr1 | 91963738 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.02 | 反式 | ||
rs17535450 | chr2 | 39900012 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.01 | 反式 | ||
rs272110 | chr2 | 131546319 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.18 | 反式 | ||
rs9814206 | chr3 | 74573226 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.11 | 反式 | ||
rs1691463 | chr3 | 84914366 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.01 | 反式 | ||
rs394185 | chr3 | 84959076 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.09 | 反式 | ||
rs9288980 | chr3 | 112964991 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.16 | 反式 | ||
rs3995908 | chr3 | 112998529 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.16 | 反式 | ||
rs7652801 | chr3 | 113008605 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.16 | 反式 | ||
rs2922180 | chr3 | 125280472 | TNFRSF11B | 4982年 | 7.331平台以及 | 反式 | ||
rs2971271 | chr3 | 125450402 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.01 | 反式 | ||
rs2976809 | chr3 | 125451738 | TNFRSF11B | 4982年 | 2.874 e-6 | 反式 | ||
rs9917710 | chr3 | 176280218 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.18 | 反式 | ||
rs16889842 | chr4 | 9872012 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.03 | 反式 | ||
snp_a - 1976228 | 0 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.13 | 反式 | |||
snp_a - 2065799 | 0 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.06 | 反式 | |||
rs6856952 | chr4 | 74394402 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.06 | 反式 | ||
rs17005214 | chr4 | 82845432 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.06 | 反式 | ||
rs2732167 | chr4 | 88706292 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.17 | 反式 | ||
rs313946 | chr4 | 113975904 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.07 | 反式 | ||
rs17034860 | chr4 | 135177933 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.14 | 反式 | ||
rs17636193 | chr5 | 3540160 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.09 | 反式 | ||
rs1867710 | chr5 | 3576228 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.15 | 反式 | ||
rs11747698 | chr5 | 3577007 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.15 | 反式 | ||
rs13174189 | chr5 | 3579173 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.19 | 反式 | ||
rs13187916 | chr5 | 3580498 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.15 | 反式 | ||
rs13170862 | chr5 | 3582215 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.15 | 反式 | ||
rs10050805 | chr5 | 30805352 | TNFRSF11B | 4982年 | 0 | 反式 | ||
rs837115 | chr5 | 40736290 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.03 | 反式 | ||
rs16894149 | chr5 | 61013724 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.1 | 反式 | ||
rs17143695 | chr5 | 117520843 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.06 | 反式 | ||
rs11954814 | chr5 | 155088338 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.2 | 反式 | ||
rs17056435 | chr5 | 158453782 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.02 | 反式 | ||
rs17135501 | chr6 | 2704474 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.04 | 反式 | ||
rs17135521 | chr6 | 2707631 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.04 | 反式 | ||
snp_a - 1787926 | 0 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.04 | 反式 | |||
rs6920042 | chr6 | 67907570 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.14 | 反式 | ||
rs6939897 | chr6 | 67913123 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.14 | 反式 | ||
rs6455226 | chr6 | 67930295 | TNFRSF11B | 4982年 | 6.269的军医 | 反式 | ||
rs2064428 | chr6 | 85067126 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.01 | 反式 | ||
rs9451867 | chr6 | 92659609 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.01 | 反式 | ||
rs283058 | chr6 | 118625224 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.14 | 反式 | ||
rs2398707 | chr7 | 2113428 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.03 | 反式 | ||
rs3778948 | chr7 | 2123290 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.09 | 反式 | ||
rs3778951 | chr7 | 2125319 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.03 | 反式 | ||
rs3778957 | chr7 | 2127710 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.03 | 反式 | ||
rs3778958 | chr7 | 2127794 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.09 | 反式 | ||
rs3778968 | chr7 | 2139903 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.09 | 反式 | ||
rs2286089 | chr7 | 38789903 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.11 | 反式 | ||
rs10085487 | chr7 | 38870379 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.06 | 反式 | ||
rs7782277 | chr7 | 38938053 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.16 | 反式 | ||
rs2430483 | chr7 | 104548631 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.02 | 反式 | ||
rs1960369 | chr8 | 6379235 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.1 | 反式 | ||
rs2199402 | chr8 | 9201002 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.02 | 反式 | ||
rs2169384 | chr8 | 9216985 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.06 | 反式 | ||
rs1381350 | chr8 | 9217194 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.17 | 反式 | ||
rs7841407 | chr8 | 9243427 | TNFRSF11B | 4982年 | 0 | 反式 | ||
rs2739708 | chr8 | 17992280 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.01 | 反式 | ||
rs714131 | chr8 | 17992832 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.02 | 反式 | ||
rs2739726 | chr8 | 17998576 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.02 | 反式 | ||
rs2919377 | chr8 | 32573740 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.04 | 反式 | ||
rs9410375 | chr9 | 91444622 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.06 | 反式 | ||
rs2253777 | chr9 | 93467893 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.02 | 反式 | ||
rs4743989 | chr9 | 97859191 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.13 | 反式 | ||
rs998410 | chr9 | 117622673 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.06 | 反式 | ||
rs9423711 | chr10 | 2574802 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.03 | 反式 | ||
rs651134 | chr10 | 27549960 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.17 | 反式 | ||
rs748375 | chr10 | 33440178 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.07 | 反式 | ||
rs4514358 | chr10 | 43861923 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.05 | 反式 | ||
rs7081666 | chr10 | 47673800 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.01 | 反式 | ||
rs10886877 | chr10 | 85425690 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.03 | 反式 | ||
rs10488758 | chr11 | 103493095 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.04 | 反式 | ||
rs1905067 | chr11 | 103493989 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.01 | 反式 | ||
rs10895512 | chr11 | 103553194 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.04 | 反式 | ||
rs11604394 | chr11 | 103554879 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.02 | 反式 | ||
rs11603978 | chr11 | 103555057 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.02 | 反式 | ||
rs11225972 | chr11 | 103555992 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.02 | 反式 | ||
rs11225974 | chr11 | 103560499 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.02 | 反式 | ||
rs11225990 | chr11 | 103608380 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.04 | 反式 | ||
rs10747972 | 0 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.08 | 反式 | |||
rs10879027 | chr12 | 70237156 | TNFRSF11B | 4982年 | 2.689的军医 | 反式 | ||
rs11112163 | chr12 | 105072508 | TNFRSF11B | 4982年 | 0 | 反式 | ||
rs9551590 | chr13 | 29589464 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.05 | 反式 | ||
rs17073665 | chr13 | 81541961 | TNFRSF11B | 4982年 | 0 | 反式 | ||
rs11840833 | chr13 | 94378306 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.02 | 反式 | ||
rs16975617 | chr13 | 110867407 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.09 | 反式 | ||
rs10142086 | chr14 | 35135892 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.02 | 反式 | ||
rs1951867 | chr14 | 54407191 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.01 | 反式 | ||
rs2093759 | chr14 | 97171024 | TNFRSF11B | 4982年 | 0 | 反式 | ||
rs17244419 | chr14 | 97171074 | TNFRSF11B | 4982年 | 5.97 e-5 | 反式 | ||
rs17629301 | chr14 | 99467034 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.05 | 反式 | ||
rs7177212 | chr15 | 34425413 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.11 | 反式 | ||
rs16976022 | chr15 | 55454260 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.19 | 反式 | ||
rs16976029 | chr15 | 55455268 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.17 | 反式 | ||
rs16976036 | chr15 | 55456921 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.13 | 反式 | ||
rs8034402 | chr15 | 55480932 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.02 | 反式 | ||
rs8043029 | chr15 | 55486010 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.02 | 反式 | ||
rs3809540 | chr15 | 55489411 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.02 | 反式 | ||
rs7165491 | chr15 | 55500454 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.18 | 反式 | ||
rs7165622 | chr15 | 93979910 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.19 | 反式 | ||
rs4984405 | chr15 | 95260170 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.14 | 反式 | ||
rs13380712 | chr16 | 25601181 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.05 | 反式 | ||
rs16977927 | chr17 | 72154232 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.08 | 反式 | ||
rs7236104 | chr18 | 14032818 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.18 | 反式 | ||
rs4987765 | chr18 | 60905021 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.12 | 反式 | ||
rs11873703 | chr18 | 61448702 | TNFRSF11B | 4982年 | 0 | 反式 | ||
rs6017989 | chr20 | 45329846 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.19 | 反式 | ||
rs6095741 | chr20 | 48666589 | TNFRSF11B | 4982年 | 6 e - | 反式 | ||
rs5991662 | chrX | 43335796 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.01 | 反式 | ||
rs2254586 | chrX | 117855503 | TNFRSF11B | 4982年 | 0.14 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG细胞因子细胞因子受体的相互作用 | 267年 | 161年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
父母MTOR信号了 | 567年 | 375年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
森古普塔和LMP1鼻咽癌 | 408年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PIEPOLI LGI1目标了 | 15 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
图姆收缩期心力衰竭 | 423年 | 283年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SENESE HDAC1目标了 | 457年 | 269年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SENESE HDAC1和HDAC2目标 | 238年 | 144年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SENESE HDAC2目标了 | 114年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SENESE HDAC3目标了 | 501年 | 327年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
长岛NRG1信号了 | 176年 | 123年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
长岛EGF信号了 | 58 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日WT1目标12小时 | 162年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗德里格斯甲状腺未分化癌DN | 537年 | 339年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN GOZGIT ESR1目标 | 781年 | 465年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DELYS甲状腺癌DN | 232年 | 154年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN CHEBOTAEV GR目标 | 120年 | 73年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GAUSSMANN MLL AF4融合目标F | 185年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BERENJENO改变了RHOA DN | 394年 | 258年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
埃尔南德斯有丝分裂异常DOCETACEL 4海里 | 23 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
埃尔南德斯有丝分裂逮捕多西他赛1 | 36 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FUNG IL2信号2 | 12 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FUNG和STAT5 IL2目标结合位点T1 | 9 | 7 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
留置权乳腺癌化生的VS导管 | 83年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SASAI抗肿瘤TRANSFROMATION | 50 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布伊泰尔特说光动力治疗压力 | 811年 | 508年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
里克曼头颈癌 | One hundred. | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NIKOLSKY乳腺癌8 q23处抓起扩增子 | 157年 | 87年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ROZANOV MMP14目标子集 | 33 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ROZANOV MMP14目标了 | 266年 | 171年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WILLERT WNT信号 | 24 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FLECHNER活检肾移植排斥和好的DN | 546年 | 351年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FLECHNER活检肾移植好的VS捐赠 | 555年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
康被叔 | 89年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
任肺泡横纹肌肉瘤DN | 408年 | 274年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病早期布莱洛克的了 | 390年 | 242年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王SMARCE1 DN的目标 | 371年 | 218年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
崔TCF21目标2 DN | 830年 | 547年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BANDRES应对CARMUSTIN管理24小时DN | 33 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陆衰老的大脑了 | 262年 | 186年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布朗感染血巨细胞病毒18 hr DN | 178年 | 121年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RODWELL老化肾脏没有血液 | 222年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RODWELL肾脏老化了 | 487年 | 303年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
LY老化中间了 | 14 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
斯坦ESRRA DN的目标 | 105年 | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DE YY1 DN的目标 | 92年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萧述三骨DN乳腺癌复发 | 315年 | 197年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
乳腺癌萧述三腔的DN | 564年 | 326年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萧述三乳腺癌基底 | 648年 | 398年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BOQUEST干细胞培养与新鲜 | 425年 | 298年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
蔡应对放射治疗 | 32 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
LINDSTEDT树突状细胞成熟C | 69年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
COLINA 4 ebp1和4 ebp2的目标 | 356年 | 214年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
斯坦ESRRA目标 | 535年 | 325年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
黄成人组织干细胞模块 | 721年 | 492年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
中村脂肪形成早期DN | 38 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
霍夫曼时钟目标了 | 11 | 7 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
赛对促性腺激素DN | 87年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萨松应对FORSKOLIN DN | 88年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李诱导T自然杀伤 | 307年 | 182年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过TP53棕熊短波紫外线反应B组 | 549年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MIYAGAWA EWSR1 ETS融合DN的目标 | 229年 | 135年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PLASARI TGFB1 10人力资源的目标 | 199年 | 143年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PLASARI NFIC目标基底 | 27 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
德拉克洛瓦RARG绑定MEF | 367年 | 231年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
德拉克洛瓦RAR目标了 | 48 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FORTSCHEGGER PHF8目标了 | 279年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PEDRIOLI MIR31目标了 | 221年 | 120年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
冯氏TNF通过P38完成响应 | 227年 | 151年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |