基因页:TP63
Summary?
基因 | 8626 |
象征 | TP63 |
同义词 | AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L |
描述 | 肿瘤蛋白p63 |
Reference | MIM:603273|HGNC:HGNC:15979|Ensembl:ENSG0000000073282|HPRD:04469|Vega:Otthumg00000156313 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q28 |
Pascal P值 | 0.429 |
主持人 | 元 |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
简历:Phewas | phenome-wide association studies (PheWAS) | 157个与精神分裂症相关的SNP | 1 |
网络 | Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network | PPI网络中最短路径的贡献:0.0143 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
简历:Phewas
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10937405 | 3 | 189383183 | 无效的 | 1.465 | TP63 | 无效的 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
No co-expressed genes in brain regions
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003700 | transcription factor activity | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0016564 | transcription repressor activity | 艾达 | 12446784 | |
GO:0016563 | transcription activator activity | 艾达 | 12446784 | |
GO:0016563 | transcription activator activity | nas | 9774969 | |
GO:0042802 | 相同的蛋白质结合 | IPI | 12446779 | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0002347 | 对肿瘤细胞的反应 | IEA | - | |
GO:0006917 | 诱导凋亡 | TAS | 9662378 | |
GO:0006915 | 凋亡 | 艾达 | 9774969 | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
GO:0051289 | 蛋白质同质化 | IPI | 10373484 | |
去:0030308 | 细胞生长的负调控 | IEA | - | |
GO:0045747 | positive regulation of Notch signaling pathway | 艾达 | 11641404 | |
GO:0045892 | 转录,DNA依赖性的负调控 | 艾达 | 12446784 | |
GO:0045893 | 转录,DNA依赖性的阳性调节 | 艾达 | 12446784 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005856 | 细胞骨架 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005634 | nucleus | 艾达 | 12446779 | |
去:0005634 | nucleus | nas | 9774969 | |
去:0005737 | cytoplasm | 艾达 | 10657951 | |
GO:0005925 | 局灶性粘附 | 艾达 | 18029348 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | miRNA ID | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-101 | 2211 | 2217 | M8 | hsa-miR-101 | uacaguacugauaacugaag |
mir-130/301 | 422 | 428 | M8 | HSA-MIR-130Abrain | cagugcaauguaaaaggggau |
hsa-miR-301 | cagugcaauaugucaaagc | ||||
HSA-MIR-130bbrain | Cagugcaaugaagggauggau | ||||
HSA-MIR-454-3P | uagugcaauauugcuuauaggguuu | ||||
mir-19 | 1656 | 1662 | 1a | HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga |
HSA-MIR-19B | UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA | ||||
mir-25/32/92/363/367 | 2734 | 2740 | 1a | hsa-miR-25brain | Cauugcacuugucucggucuga |
HSA-MIR-32 | uauugcacauacuaaguugc | ||||
HSA-MIR-92 | uauugcacuugucccgcgcug | ||||
HSA-MIR-367 | Aauugcacuuuagcaaugga | ||||
HSA-MIR-92BSZ | uauugcacucgucccgcgcuc | ||||
miR-363 | 1686 | 1692 | 1a | HSA-MIR-363 | auugcacgguauccaucuguaa |
miR-377 | 1754年 | 1761 | 1A,M8 | HSA-MIR-377 | aucacacaaaggaacuuuuugu |
miR-493-5p | 2561 | 2567 | 1a | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 | 424 | 430 | 1a | HSA-MIR-93brain | aaagugcuguucgugcagguag |
hsa-miR-302a | uaagugcuugcauguuuguga | ||||
hsa-miR-302b | uaagugcuuccauguuuaguag | ||||
hsa-miR-302c | uaagugcuuccauguucagugg | ||||
hsa-miR-302d | Uaagugcuauguugugugu | ||||
HSA-MIR-372 | aaagugcugcgacauuugagcgu | ||||
HSA-MIR-373 | Gaagugcuucgauuuggggugu | ||||
HSA-MIR-520E | Aaagugcuuuuuugaggg | ||||
hsa-miR-520a | aaagugcuucccuuguggugu | ||||
hsa-miR-520b | aaagugcuuuuuuagaggg | ||||
hsa-miR-520c | aaagugcuuuuuuaggggug | ||||
hsa-miR-520d | aaaguguuugugggguggguu |