Summary
基因ID 7402
Symbol Utrn
同义词 DMDL | DRP | DRP1
描述 乌托芬
参考 MIM:128240|HGNC:HGNC:12635|Ensembl:ENSG00000152818|HPRD:00547|Vega:Otthumg0000000015746
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q24
Pascal P值 0.282
胎儿β -0.172
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 CompositeSet

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 Hits with neuro-related keywords: 1
网络 Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network PPI网络中最短路径的贡献:0.0156

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 Sift CG46 特征 学习
Utrn CHR6 145073047 C t NM_007124 p.2772r> c missense Schizophrenia DNM:Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
rs7738467 CHR6 145457783 Utrn 7402 0.15 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003779 肌动蛋白结合 IEA -
去:0005509 calcium ion binding IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 8576247
去:0005198 结构分子活性 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007517 肌肉发育 塔斯 9288751
去:0006936 肌肉收缩 塔斯 9288751
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0045211 突触后膜 IEA 突触,神经递质(GO期限:5) -
GO:0045202 突触 IEA 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) -
去:0005856 细胞骨架 塔斯 8977119
去:0005624 膜分数 塔斯 1426262
去:0005737 cytoplasm IEA -
去:0005886 质膜 塔斯 8977119
GO:0030054 cell junction IEA -

部分V。Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Biocarta AGR途径 36 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
thum收缩性心力衰竭 423 283 All SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌基础与间充质DN 50 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rodrigues DCC目标DN 121 84 All SZGR 2.0 genes in this pathway
runx1 runx1t1融合单核细胞DN的TONKS目标 54 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC1靶向DN 260 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC3靶向DN 536 332 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应表皮DN 508 354 All SZGR 2.0 genes in this pathway
chiaradonna肿瘤转化CDC25 DN 153 100 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 All SZGR 2.0 genes in this pathway
McBryan Pubertal乳房6 7WK DN 79 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
McBryan Pubertal TGFB1靶向 169 127 All SZGR 2.0 genes in this pathway
EBAUER目标PAX3 FOXO1融合起来 207 128 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PAX3 FOXO1融合的Ebauer肌原靶标 50 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LE EGR2目标DN 108 84 All SZGR 2.0 genes in this pathway
IVANOVA HEMATOPOIESIS STEM CELL LONG TERM 302 191 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LIAN LIPA TARGETS 6M 74 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chuang氧化应激反应DN 11 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lian Lipa目标3M 59 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
外邦紫外线低剂量DN 67 46 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 5 482 296 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zheng由Foxp3绑定 491 310 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ZHENG FOXP3 TARGETS IN T LYMPHOCYTE DN 37 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MOLENAAR TARGETS OF CCND1 AND CDK4 UP 67 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 All SZGR 2.0 genes in this pathway
开罗肝母细胞瘤 207 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1目标汇合 567 365 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 6HR DN 91 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gabriely miR21靶标 289 187 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 1600 1607年 1A,M8 HSA-LET-7A ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU
HSA-LET-7E ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98 UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I ugagguaguugugugugugcugu
mir-1/206 400 406 M8 HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
hsa-miR-206SZ UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-142-3p 1863年 1870年 1A,M8 HSA-MIR-142-3P uguaguuuccuacuuuaugga
mir-153 223 230 1A,M8 HSA-MIR-153 UUGCAUAGUCACAAAAGUGA
mir-381 286 292 1a HSA-MIR-381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
mir-410 1569 1575年 1a HSA-MIR-410 AAUAUAACACAGAUGGCCUGU
mir-448 224 230 1a hsa-miR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-9 160 166 1a HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga