基因页:Utrn
Summary?
基因ID | 7402 |
Symbol | Utrn |
同义词 | DMDL | DRP | DRP1 |
描述 | 乌托芬 |
参考 | MIM:128240|HGNC:HGNC:12635|Ensembl:ENSG00000152818|HPRD:00547|Vega:Otthumg0000000015746 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q24 |
Pascal P值 | 0.282 |
胎儿β | -0.172 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | CompositeSet |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 1 | |
网络 | Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network | PPI网络中最短路径的贡献:0.0156 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | Sift | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Utrn | CHR6 | 145073047 | C | t | NM_007124 | p.2772r> c | missense | Schizophrenia | DNM:Fromer_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs7738467 | CHR6 | 145457783 | Utrn | 7402 | 0.15 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003779 | 肌动蛋白结合 | IEA | - | |
去:0005509 | calcium ion binding | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 8576247 | |
去:0005198 | 结构分子活性 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007517 | 肌肉发育 | 塔斯 | 9288751 | |
去:0006936 | 肌肉收缩 | 塔斯 | 9288751 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触,神经递质(GO期限:5) | - |
GO:0045202 | 突触 | IEA | 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) | - |
去:0005856 | 细胞骨架 | 塔斯 | 8977119 | |
去:0005624 | 膜分数 | 塔斯 | 1426262 | |
去:0005737 | cytoplasm | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | 塔斯 | 8977119 | |
GO:0030054 | cell junction | IEA | - |
部分V。Pathway annotation
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
Let-7/98 | 1600 | 1607年 | 1A,M8 | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
HSA-LET-7D脑 | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU | ||||
HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
HSA-MIR-98脑 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU | ||||
HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
mir-1/206 | 400 | 406 | M8 | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
hsa-miR-206SZ | UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG | ||||
HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
mir-142-3p | 1863年 | 1870年 | 1A,M8 | HSA-MIR-142-3P | uguaguuuccuacuuuaugga |
mir-153 | 223 | 230 | 1A,M8 | HSA-MIR-153 | UUGCAUAGUCACAAAAGUGA |
mir-381 | 286 | 292 | 1a | HSA-MIR-381 | UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU |
mir-410 | 1569 | 1575年 | 1a | HSA-MIR-410 | AAUAUAACACAGAUGGCCUGU |
mir-448 | 224 | 230 | 1a | hsa-miR-448 | uugcauauguaggauguccccau |
mir-9 | 160 | 166 | 1a | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |