概括
基因 222696
象征 ZSCAN23
同义词 Znf390 | Znf453 | DJ29K1.3 | DJ29K1.3.1
描述 锌指和包含23的扫描域
参考 HGNC:HGNC:21193|Ensembl:ENSG00000187987|Vega:Otthumg0000000016346
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p22.1
Pascal P值 1E-12
胎儿β 0.933
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
海马
下丘脑
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1150691 6 28168033 ZSCAN23 ENSG00000187987.5 9.20779E-7 0.02 243246 gtex_brain_putamen_basal
RS201833612 6 28381225 ZSCAN23 ENSG00000187987.5 5.14065E-6 0.02 30054 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003700 转录因子活性 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0006350 转录 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005634 IEA -