基因页:ZSCAN23
概括?
基因 | 222696 |
象征 | ZSCAN23 |
同义词 | Znf390 | Znf453 | DJ29K1.3 | DJ29K1.3.1 |
描述 | 锌指和包含23的扫描域 |
参考 | HGNC:HGNC:21193|Ensembl:ENSG00000187987|Vega:Otthumg0000000016346 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p22.1 |
Pascal P值 | 1E-12 |
胎儿β | 0.933 |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 海马 下丘脑 梭子基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1150691 | 6 | 28168033 | ZSCAN23 | ENSG00000187987.5 | 9.20779E-7 | 0.02 | 243246 | gtex_brain_putamen_basal |
RS201833612 | 6 | 28381225 | ZSCAN23 | ENSG00000187987.5 | 5.14065E-6 | 0.02 | 30054 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZSCAN23_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003700 | 转录因子活性 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
去:0006350 | 转录 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | IEA | - |