基因页：ZSWIM6
概括？
| 基因 | 57688 |
| 象征 | ZSWIM6 |
| 同义词 | 后 |
| 描述 | 锌指泳型含6 |
| 参考 | MIM：615951|HGNC：HGNC：29316|Ensembl：ENSG00000130449|Vega：Otthumg00000162388 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5q12.1 |
| Pascal P值 | 5.955e-10 |
| 胎儿β | 0.998 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| LK：是的 | 全基因组协会研究 | 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV：RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历：PGC128
简历：PGC128| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4391122 | CHR5 | 60598543 | Ag | 1.734E-13 | 基因间 | CTC-436P18.1，ZSWIM6 | dist = 70636; dist = 29557 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG18259253 | 5 | 60745986 | ZSWIM6 | 4.709E-4 | 0.498 | 0.046 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| WDR74 | 0.92 | 0.90 |
| trim39 | 0.89 | 0.88 |
| PQBP1 | 0.88 | 0.88 |
| NFKBIL1 | 0.88 | 0.87 |
| SPSB3 | 0.88 | 0.91 |
| WDR46 | 0.88 | 0.87 |
| MRPS34 | 0.87 | 0.87 |
| FAM89B | 0.86 | 0.89 |
| GFER | 0.86 | 0.88 |
| EIF6 | 0.86 | 0.85 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.71 | -0.77 |
| MT-CO2 | -0.70 | -0.75 |
| mt-cyb | -0.70 | -0.78 |
| AF347015.33 | -0.69 | -0.76 |
| AF347015.27 | -0.69 | -0.77 |
| AF347015.8 | -0.69 | -0.76 |
| AF347015.15 | -0.67 | -0.76 |
| AF347015.2 | -0.67 | -0.75 |
| AF347015.26 | -0.66 | -0.77 |
| 鼻孔 | -0.64 | -0.73 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Gargalovic对氧化的磷脂洋红色的反应 | 28 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇3 DN | 229 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP63目标 | 355 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP53和TP63目标 | 205 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim Myc放大目标DN | 97 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim Mycn扩增靶向 | 92 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh他莫昔芬抵抗DN | 258 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤C DN | 59 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 | 259 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma ns | 162 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang 3类由EGF瞬时诱导 | 222 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |