1 摩尔自闭症2014 -1 5:1
PMID 24410847
标题 对自闭症的大家庭的外显子组测序揭示了神经发育和神经精神疾病中共有的基因。
抽象的 自闭症谱系障碍(ASDS)包括一系列不同严重程度的神经发育状况,其特征是社会相关性,沟通和行为上明显的定性困难。尽管有大量遗传力的证据,但迄今为止,遗传研究的结果表明,ASD病因是非常异质的,只发现了一小部分自闭症基因。
为了帮助阐明这种遗传复杂性,我们对来自40个具有远距离影响个体的40个家庭的100个ASD个体进行了整个外显子组测序。所有家庭都至少包含一对ASD堂兄。每个人都被敏捷的SURESELECT人类全部外显子试剂盒捕获,并在Illumina Hiseq 2000上进行了测序,并用Burrows-Wheeler Anigner(BWA),基因组分析工具基(GATK)(GATK)和SETTLESEQ进行了处理和注释。利用了有关每个家庭的基因分型信息,以确定下降相同的基因组区域(IBD)。然后评估通过IBD区域中发生并存在于每个家庭中所有受影响个体中的外显子组测序鉴定的变体,以确定哪些可能与疾病有关。优先考虑新颖且罕见的核苷酸改变(MAF,小于0.05),预计会通过改变氨基酸或剪接模式有害。
我们确定了以前与自闭症无关的基因中的许多潜在损害,与ASD相关的风险变异。这些基因的一个子集已与其他神经行为疾病有关,包括抑郁症(SLIT3),癫痫(CLCN2,Prickle1),智力障碍(AP4M1),精神分裂症(WDR60)和Tourette综合征(OFCC1)。在先前报道的自闭症候选基因中发现了其他改变,包括三个基因,其中有多个家族的改变(CEP290,CSMD1,FAT1和STXBP5)。从文献中汇编了ASD候选基因列表,我们确定在ASD候选基因中发生的变体是比外显子测序捕获的随机基因的频率高1.65倍(p?=?=?8.55-10-5)。
通过研究这些独特的谱系,我们已经确定了与ASD相关的新型DNA变异,证明了大家庭中的外显子组测序是ASD候选基因发现的强大工具,并为广泛的神经发育和神经性精神提供了潜在的遗传成分的进一步证据疾病。
SCZ关键字 精神分裂症
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