1 Pharmacogenet。基因组学2014年6月24日:314-9
PMID 24751813
标题 全基因组关联研究支持免疫系统和神经发育过程的作用,以响应氟哌啶醇治疗。
抽象的 该研究的目的是检测氟哌啶醇对氟哌啶醇的遗传预测因子。
氟哌啶醇是一种用于药理治疗的基准药物精神分裂症,但是其功效的遗传学尚未阐明。
在用氟哌啶醇治疗(n = 96)的一小部分患者中进行了全基因组关联分析,并将结果复制在较大的用第二代抗精神病药或内嗪治疗的患者样本中(最终n = 169,可从用于干预有效性研究的临床抗精神病药试验)。阳性和阴性症状量表%评分降低是两个样本的结果。在复制样本中,观察期限仅限于1个月,最严重的病例被包括在内,以最大程度地平衡复制。调查和复制样本的质量控制(QC)包括次要等位基因频率至少0.01,呼叫速率至少0.95,而Hardy-Weinberg平衡P则至少为0.0001。插补的来源是1000个基因组PILOT+HAPMAP 3数据集。总共1 080 870单核苷酸多态性(SNP)在研究样本中插算后可用。在真实基因型的QC之后,以基因座为目标的插图仅限于复制样本中哨兵SNP两侧的10 kb的窗户。Sentinel SNP是调查样本中最重要的发现。方差分析是选择,PLINK,SNPTEST和GTOOOL的测试。
两个样品中的两个SNP(RS7912580和RS2412459)分别与位于AT富集的交互式结构域5B(ARID5B,MRF1样)基因和Rhotekin 2(Rhotekin 2(RTKN2)基因,位于真核翻译起始因子2中的内含子区域?激酶4(EIF2AK4)基因(p = 1.358e-06和0.015的正症状和阴性症状量表分别在研究和复制样本中总分降低)。在两个样本中,关联方向相反,这一发现有时被报道为触发器关联。
祖先等位基因的杂合病与研究样本中最佳改进有关,复制样本中的结果较差。这种差异可能是由于复制和研究样本的差异,包括所使用的药物和基线处的严重程度。然而,这一发现与两个相关假设一致精神分裂症,与免疫系统的改变有关(RTKN2)和中枢神经系统神经发育(EIF2AK4)。有必要进行更多的研究以进一步研究这些关联。
SCZ关键字 精神分裂症
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