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ZNF804A（锌指蛋白804a）已被确定为候选基因精神分裂症（SZ），自闭症谱系障碍（ASD）和双相情感障碍（BD）在重复的基因组广泛关联研究（GWAS）和拷贝数变化（CNV）分析中。尽管其功能尚未得到充分的特征，但ZnF804A包含C2H2型锌指域，表明它具有DNA结合特性，因此在调节基因表达中起作用。为了进一步探索ZnF804A对基因表达及其下游靶标的作用，我们使用了一种基因敲低（KD）方法来减少其在诱导多能干细胞（IPSC）中衍生出的神经祖细胞（NPC）中的表达。KD是通过RNA干扰（RNAI）使用含有靶向Znf804a mRNA的shRNA的慢病毒颗粒来完成的。选择嘌呤霉素后，产生稳定的转导NPC线。还产生了表达随机（加扰）shRNA的对照细胞系。诱导神经元分化，14天后收集RNA，并使用RNA-Seq进行转录组分析。发现1815个基因在名义显着水平上以差异表达（p <0.05）；809在KD样品中的表达降低，而1106的表达增加了。其中，有370个实现了基因组广泛的意义（FDR <0.05）； 125 were lower in the KD samples, 245 were higher. Pathway analysis showed that genes involved in interferon-signaling were enriched among those that were down-regulated in the KD samples. Correspondingly, ZNF804A KD was found to affect interferon-alpha 2 (IFNA2）介导的基因表达。研究结果表明，ZNF804A可能会影响神经元对炎症细胞因子的反应，这与支持传染病作用的SZ和ASD模型一致，并且在患者亚组中的自身免疫性。 |