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监管机构的组蛋白H3-trimethyl lysine-4 (H3K4me3)马克明显与常见的神经发育疾病的遗传风险的体系结构,包括精神分裂症和自闭症。典型H3K4me3主要是局部的感染高峰,扩展在神经细胞染色质平均只有500 - 1500碱基对主要在转录起始点的靠近注释。这里,通过综合计算分析外遗传性和基于新一代测序转录组的数据,我们研究了H3K4me3风景的人类死后的神经元和non-neuronal核排序,非人类的灵长类动物和鼠标前额叶皮层(PFC)和血液。探索是否H3K4me3峰值信号也可以扩展到更广泛的领域,我们检查了广泛的细胞类型特异的H3K4me3域峰和一个创新的方法以公正的方式41 + 12 ChIP-seq RNA-seq数据集。在PFC神经元,宽泛的H3K4me3分布范围从3.9到12 ?kb,极其广泛的山峰(~ 10 ?kb或更广泛的)与突触功能和gaba ergic信号(DLX1,ELFN1、GAD1 IGSF9B和LINC00966)。广泛的神经元峰显示不同的主题签名和集中定位在前额叶基因调控贝叶斯网络和敏感神经发育缺陷。大约120的广泛H3K4me3山峰在人类PFC神经元,包括许多基因与glutamatergic和多巴胺能的信号,是完全守恒在黑猩猩、猕猴和小鼠皮层神经元。探索传播和广度赖氨酸的甲基化标记为表观遗传机制可以提供新的见解参与神经精神疾病和神经细胞基因组的进化。 |