1 BMC Bioinforformatics 2011 -1 12 Suppl 13:S20
PMID 22373040
标题 精神分裂症,躁郁症和严重抑郁症的蛋白质 - 蛋白质相互作用网络的构建和分析。
抽象的 精神分裂症,躁郁症和严重抑郁症是毁灭性的精神疾病,每种疾病具有独特而重叠的流行病学特征。微阵列和蛋白质组学数据揭示了患者异常表达的基因。几种单核苷酸多态性(SNP)和突变与三种疾病中的一个或多个有关。然而,关于疾病相关基因和蛋白质之间相互作用的研究很少。
这项研究首次融合了微阵列和蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)数据库,以构建在验尸后脑样本中异常表达基因的PPI网络精神分裂症,躁郁症和重度抑郁症患者。样品是从前额叶皮层的Brodmann地区(BA)10收集的。通过比较疾病和对照样本的t检验选择异常表达的疾病基因。这些基因参与了家政功能(例如翻译,转录,能量转化和代谢),大脑特异性功能(例如信号转导,神经元细胞分化和细胞骨架)或压力反应(例如,热冲击和生物压力)。这些疾病是通过PPI网络中的几个类似“总机”的节点或共享表达的基因相互联系的。还观察到由Clique-5和-4S的紧密编织子网络组成的“核心”功能模块。这些集团由在疾病和对照样品中高度表达的12个基因形成。
几个先前未识别的疾病标记基因和药物靶标,例如SBNO2(精神分裂症),sec24c(双相情感障碍)和srrt(严重抑郁症)根据PPI网络的统计和拓扑分析确定。共享或互连标记基因可能解释了研究疾病的共同症状。此外,由于其功能和拓扑意义,因此提出了“ APP,UBC和YWHAZ”等“总机”基因作为开发新处理的潜在靶标。
SCZ关键字 精神分裂症
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